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A Bayesian framework for high-throughput T cell receptor pairing
DOI:10.1093/bioinformatics/bty801.png)
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研究动机
T细胞受体(TCR)库的研究为免疫系统识别机制提供了新的见解。然而,对这类群体进行稳健表征的能力受到了技术障碍以及无法可靠推断TCR异源二聚体链配对的限制。
结果
本研究描述了一种针对新兴免疫库测序方法的创新性分析方法,提升了该低成本技术的解析能力。该方法依赖于将T细胞群体分布在一个96孔板中,随后对每个T细胞的相关转录本进行条形码标记和测序。高产量配对链评估的多细胞分析解卷积(MAD-HYPE)利用贝叶斯推断更准确地提取TCR信息,提高了我们研究和表征T细胞群体的能力,以应用于免疫学和免疫治疗领域。
可用性与实现
MAD-HYPE算法作为开源项目发布,遵循Apache许可证,可从https://github.com/birnbaumlab/MAD-HYPE获取。
补充信息
补充数据可在Bioinformatics在线获取。
AI总结
对已上传原文的论文进行重点信息的提取,主要内容包括:简要概述、研究摘要、背景介绍、关键亮点、图文解析、展望与总结。
期刊
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机构
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引用论文
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