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A machine-assisted framework for systematic error analysis in clinical concept extraction

delete2026-08-26
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OA
AI
S
Sunyang Fu
Q
Qiuhao Lu
J
Jaerong Ahn
F
Fang Chen
H
Hanyun Yin
J
Julia Wen
Z
Zhiyi Yue
T
Taylor Harrison
J
Jiang Jun
X
Xiaoyang Ruan
M
Ming Huang
A
Andrew Wen
L
Liwei Wang
M
Min Ji Kwak
N
Nahid Rianon
Y
Yanshan Wang
R
Ruihong Huang
Hongfang Liu 封面图
Hongfang Liu (Hongfang Liu) *
DOI:10.1038/s41467-026-77067-1delete
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摘要

摘要

En 中文
错误分析对于评估和改进临床自然语言处理(NLP)模型至关重要,但目前尚无标准化框架支持临床概念提取的系统错误分析。本文提出MedError框架,该框架由机器辅助、人机协同构成,集成了验证过的错误分类体系、大语言模型(LLM)辅助分类和结构化标注工作流程。MedError基于来自三家机构4227份临床记录中手动整理的1187个独特错误开发而成,涵盖25种错误类型和48个临床概念类别。本文通过三项互补评估表明MedError支持单机构和联邦多机构错误分析:首先,对6个专有和开源LLM的基准测试显示,仅自动化错误分类在缺乏人工参与时不足够;其次,基于MedError的错误反馈将11个认知状态概念的NLP提取性能较无结构化基线提升了34%–62%;第三,在两家独立机构的前瞻性外部验证显示,与专家裁定标注的协议提高了30%(McNemar精确检验,p=0.035,φ=0.38),标注时间减少26%–33%,为实际临床NLP部署提供了系统且实用的框架。MedError框架通过机器辅助的人机协同,提高了临床NLP错误分析的标准性、有效性和效率,支持更透明和值得信赖的模型部署。

期刊

Nature Communications 封面图
Nature Communications
IF:
15.7
论文数:
9.4W
被引数:
91.2W

机构

U
UTHealth Houston
学者数:
174
论文数: 67
被引数: 4
T
the university of texas at austin
学者数:
1.3K
论文数: 550
被引数: 0
M
mayo clinic
学者数:
8.3W
论文数: 6.6W
被引数: 85
T
texas a&m university
学者数:
3.1K
论文数: 1.2K
被引数: 0
U
university of pittsburgh
学者数:
6.3K
论文数: 2.8K
被引数: 1
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