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A New Distribution Family for Microarray Data

delete2017-02-10
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DOI:10.3390/microarrays6010005delete
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摘要

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传统微阵列数据处理方法通常应用近似正态化的变换,但缺点是会丢失原始尺度。本文采取的替代观点是寻找能够拟合数据(具有负值特征)的模型,同时保留其尺度;该策略的一个优势在于便于对结果进行直接解释。文中引入了一个以p∈R为参数的新分布族,命名为gpower-normal分布,并证明当施加适当的gpower变换时,这些变量会变为正态或截断正态分布。文中给出了基于截断正态密度的矩和分位数的表达式。该新分布族可用于建模包含非正值的不对称数据,以满足微阵列分析的需求。此外,已证明gpower-normal分布族是伪离散度模型的一个特例,继承了这些模型的所有优良性质,例如小方差时的渐近正态性。文中提出了组合最大似然法来估计模型参数,并将其应用于微阵列和污染数据。R代码可向作者索取。
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