.png){kind=icon}
返回
A practical guide to spatial transcriptomics: lessons from over 1000 samples
.png){kind=icon}
PRE
AI
DOI：10.1016/j.tibtech.2025.08.020.png)
.png){kind=icon}
原文求助.png){kind=icon}
分享.png){kind=icon}
收藏
摘要
En 中文
空间转录组学（ST）已发展为一项多学科协作的努力，其中分子生物学家、病理学家、组织技术员和计算分析人员之间的紧密协调现已被认为是成功的关键。RNA质量指标如DV200和RNA完整性编号（RIN）仍指导着预期，但近期研究显示，即使低于阈值的样本也能产生具有生物学意义的数据。测序深度指南正在演变：甲醛固定石蜡包埋（FFPE）Visium实验通常受益于100～120 k reads/spot，远高于长期以来的25 k标准。对于Xenium等靶向成像平台，更大的探针面板可能会降低单基因敏感性，突显了检测广度与深度之间的权衡。通过随机化、重复和全面的元数据追踪来防止批次效应仍是最高效的策略，因为计算校正的能力有限。
期刊
IF:
14.9
论文数:
3.8K
被引数:
2.0W
机构
引用论文
暂无论文信息