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A prognostic model for highly aggressive prostate cancer using interpretable machine learning techniques
DOI:10.3389/fmed.2025.1512870.png)
摘要
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背景 极度侵袭性前列腺癌,包括小细胞癌和神经内分泌癌等亚型,与不良预后和有限的治疗选择相关。本研究旨在创建一个稳健且可解释的基于机器学习的模型,用于预测极度侵袭性前列腺癌患者的1年、3年和5年生存率。此外,我们希望通过一种创新方法确定关键预后因素及其临床意义。
材料与方法 本研究回顾性分析了SEER数据库(2000-2020年)中1,620例极度侵袭性前列腺癌患者的数据。采用Boruta算法进行特征选择,并使用包括XGBoost、逻辑回归(LR)、支持向量机(SVM)、随机森林(RF)、k近邻(KNN)、决策树(DT)、弹性网络(Enet)、多层感知器(MLP)和lightGBM在内的九种机器学习算法进行生存预测。模型性能通过AUC、准确率(F1分数)、混淆矩阵和决策曲线分析等指标进行评估。此外,应用Shapley加性解释(SHAP)来解释模型中的特征重要性,揭示影响生存预测的临床因素。
结果 在九个模型中,lightGBM模型表现出最佳性能,1年生存预测的AUC和F1分数分别为(0.8,0.809),3年生存预测的AUC和F1分数分别为(0.809,0.751),5年生存预测的AUC和F1分数分别为(0.773,0.611)。SHAP分析显示,M分期是预测1年和3年生存的最重要特征,而PSA水平对5年生存预测的影响最大。通过决策曲线分析和混淆矩阵,模型展示了良好的临床实用性和预测准确性。
结论 lightGBM模型对极度侵袭性前列腺癌患者的生存具有良好的预测能力。通过识别关键临床因素并提供可操作的预测,该模型有望提高预后准确性并改善患者结局。
Keyword:
prostate cancer
survival
machine
predictive analytics
Boruta algorithm
期刊
F
IF:
3
论文数:
2.2W
被引数:
4.0W
机构
引用论文
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