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BioLogical: a universal analysis framework for biosystem logical dynamic
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AI
DOI：10.1016/j.csbj.2025.11.049.png)
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摘要
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复杂生物系统表现出有序、功能性和自组织的特征，但探索其逻辑范式和动态行为的通用框架仍显不足。在此，我们介绍了BioLogical，一个用户友好的R软件包，旨在分析基因调控系统的逻辑属性。通过标准工作流程和多个案例，我们展示了其在解析逻辑范式、计算生物系统的静态和动态指标、模拟系统演化以及评估逻辑可满足性等方面的多功能能力。所有概念和算法均已扩展至多值场景，并提供了分层接口以满足多样化需求。该开源软件可从https://github.com/YuxiangYao/BioLogical获取。
Keyword:
Logical analysis
Complex biosystems
Multi-valued logic
Discrete dynamic
Gene regulatory network
AI总结
对已上传原文的论文进行重点信息的提取，主要内容包括：简要概述、研究摘要、背景介绍、关键亮点、图文解析、展望与总结。
期刊
IF:
4.1
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被引数:
1.4W
机构
引用论文
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