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Coding, modifier, and regulatory effects shape circulating APOL1 levels
DOI:10.1093/hmg/ddag087.png)
摘要
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APOL1变异体G1和G2是近期撒哈拉以南非洲血统人群慢性肾脏病的主要遗传风险因素,但基因型与疾病之间的机制仍不明确。循环APOL1可能发挥关键作用,但特定基因型和调控变异如何影响循环APOL1水平尚不完全清楚。我们分析了来自43,587名英国生物银行参与者的Olink测量的APOL1 NPX(标准化蛋白质表达水平)。在近期撒哈拉以南非洲血统个体中,评估了APOL1 NPX与已知基因型的关联,包括对G1、G2、E150K(rs2239785)和N264K(rs73885316)的分析。我们还研究了APOL1位点的蛋白质数量性状位点(pQTL)和顺式作用变异,包括预测的微小RNA结合位点。结果表明,APOL1 NPX以APOL1基因型依赖的方式变化。E150K、G1和G2与APOL1 NPX表现出明显的剂量依赖关系,其中G2效应最大。在考虑APOL1基因型后,自报黑人或黑人英国族裔个体的APOL1 NPX仍较高,这与额外的调控元件一致。多个位于APOL1附近的顺式调控变异独立与APOL1 NPX相关,可能有助于解释与血统相关的差异。这些发现共同表明,APOL1基因型是APOL1 NPX的主要决定因素,且G1和G2具有不同的生物学效应。调控变异为APOL1 NPX的控制增加了另一层机制,可能有助于解释群体差异。这些发现为理解APOL1变异的基因型特异性分子效应提供了生物学框架。
期刊
IF:
3.2
论文数:
1.1W
被引数:
3.5W
机构
引用论文
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