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Computational models for pan-cancer classification based on multi-omics data
DOI:10.3389/fgene.2025.1667325.png)
摘要
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肿瘤异质性给癌症治疗带来了重大挑战,限制了临床医生进行准确早期诊断和制定个性化治疗策略的能力。早期诊断对于有效干预至关重要,然而当前方法缺乏克服这一挑战的稳健解决方案。泛癌图谱(Pan-Cancer Atlas)已作为一个关键框架出现,通过整合跨肿瘤类型的组学数据(基因组学、转录组学、蛋白质组学)来研究癌症异质性。该计划系统地绘制了肿瘤间和肿瘤内的变异,为临床决策提供见解。然而,这类框架通常难以整合肿瘤内的动态时序变化和空间异质性,限制了其实时临床应用。在本综述中,我们首先总结泛癌研究中使用的可用组学数据及公共生物医学数据库。接着,我们考察基于所用计算模型(包括机器学习和深度学习)的当前泛癌分类方法,并对这些分类方法进行比较以探讨其优缺点。最后,我们总结讨论泛癌研究中的关键挑战,并提出未来研究的潜在方向。
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