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Computer-Aided Design Software and Simulation Tools for DNA Nanoparticles
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OA
AI
DOI：10.1002/admt.202500438.png)
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摘要
En 中文
DNA纳米结构，特别是DNA折纸纳米颗粒，已被越来越多地用作结构成分，应用于材料科学、治疗学、药物发现与递送以及肿瘤治疗等复杂领域。在实现任何可行应用之前，DNA折纸必须经过精心设计、模拟和合成以进行验证。为促进这一流程，已开发出计算机辅助设计软件和模拟工具，以缓解手动设计方法学的限制。因此，本研究在时间框架内对DNA纳米颗粒的计算机辅助设计软件和模拟工具的演变进行了全面考察。在本综述中，设计方法被分为自底向上和自顶向下的策略，并归类为相关体系结构，如基于瓦片或基于框架的架构。模拟方法根据模拟模型进行分类，包括用于不同分辨率下分子动力学模拟的有限元模型和粗粒化模型。这项研究不仅概述了DNA纳米结构软件发展四十余年的进展，还展望了未来的需求，包括将DNA纳米颗粒的设计和模拟自动化整合到一个统一平台中，以及应用深度学习的进步，这些无疑将在模拟和体外实验中节省大量时间和精力。
Keyword:
DNA nanoparticles
DNA nanostructures
DNA origami
DNA nanotechnology
DNA design software and simulation tool
期刊
IF:
6.2
论文数:
5.3K
被引数:
2.4W
机构
引用论文
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