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Cytoflow: User-Friendly Python Software for Computational Flow Cytometry
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AI
DOI：10.1002/cyto.a.70058.png)
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摘要
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现代流式细胞术实验通常会测量18种或更多荧光标记物，涉及多个样本、患者和组织。随着实验复杂性的增加，手动设门变得效率低下且可能引入操作者间的差异。计算流式细胞术算法，如无监督聚类、自动设门和降维，可以提高这些分析的速度和可靠性，但使用它们需要时间和专业知识，许多生物医学科学家缺乏这些条件。Cytoflow旨在弥合这一差距。Cytoflow是一款开源、用户友好的点击式软件，用Python编写，允许非程序员将其现代计算流式细胞术方法应用于数据集。此外，Cytoflow的模块可以直接用于Python脚本或JupyterLab笔记本。最后，通过添加支持未来应用的新模块来扩展Cytoflow十分简便，活跃的用户社区反馈持续指导着持续开发。因此，Cytoflow可以节省实验者的时间，并提高其分析的可靠性和可重复性。Cytoflow可下载自https://cytoflow.github.io。源代码托管于https://github.com/cytoflow/cytoflow，文档可获取于https://cytoflow.readthedocs.io。
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