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Decoding circRNA translation: challenges and advances in computational method development
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OA
AI
DOI：10.3389/fgene.2025.1654305.png)
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摘要
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近年来，大量研究已证实环状RNA（circRNAs）能够通过编码功能蛋白发挥关键生物学作用。计算方法已成为研究circRNA翻译的必要手段。本综述首先概述了circRNA的生物发生及翻译机制，以阐明开发专用计算策略的合理性。随后，我们总结了支持计算方法发展的实验技术及现有数据库。在此基础上，我们对现有的circRNA翻译分析工具及其底层算法进行了系统性介绍，并重点利用统一数据集对基于序列的方法进行了性能基准测试。我们的基准测试结果表明：（1）cirCodAn在保持用户友好性的同时达到了更高的预测精度；（2）方法开发过程中的训练数据选择对模型性能具有决定性影响。本综述为circRNA翻译分析方法的选用与应用提供了全面参考，并为未来计算工具的开发与完善奠定了基础指导。
Keyword:
circRNA
translation
computational methods
benchmarking
predictive accuracy
期刊
IF:
2.8
论文数:
1.6K
被引数:
4.4W
机构
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