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Detecting replication-associated single-stranded DNA
DOI:10.1016/j.cbpa.2026.102773.png)
摘要
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单链DNA(ssDNA)被用作复制应激的读出指标,但其来源多样。它既是DNA复制的正常中间体,也可能在复制挑战后积累并持续存在,同时还可由复制无关过程产生。这些结构在链来源、构象、生物学后果及治疗反应上存在差异,因此仅检测ssDNA很少能识别其分子中间体或生成机制。本文描述了与复制相关的ssDNA的主要来源,并综述了不同方法如何捕获这些中间体的不同特征,包括ssDNA的暴露与可及性、DNA末端及其更广泛的结构和复制背景。由于这些特征在不同中间体中存在重叠,单一读出往往能捕获多种结构而非唯一识别一种。因此,可靠的解读需要整合互补信号、实验扰动及复制背景。未来结合这些特征的方法或能实现对单个DNA分子的直接分子分类。

