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DicePlot: a package for high-dimensional categorical data visualization
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AI
DOI：10.1093/bioinformatics/btaf337.png)
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摘要
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多维分类数据的可视化是科学领域普遍存在的挑战，特别是在生命科学中。其目标是为用户提供对底层数据的全面概览，以便评估多个变量。此类可视化在基因或通路分析中尤为有用，这些分析涉及检查已知生物机制和功能在不同条件下的失调情况。本文提出了一种新的可视化方法，以直观的方式编码此类数据：DicePlots使用类似骰子面的元素，在单一视图中可视化最多四种不同的分类类别，而DominoPlots则增加了一个用于二元比较的信息层。可用性与实现：代码以R包diceplot和PyPI上的pydiceplot形式提供。所有源代码可在https://github.com/maflot获取。联系方式：该代码库由活跃的管理团队维护，我们鼓励社区贡献和请求。
Keyword:
DicePlot
categorical data visualization
gene analysis
pathway analysis
high-dimensional data