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Disentangled Pseudo-Bag Augmentation for Whole Slide Image Multiple Instance Learning
DOI:10.1109/TMI.2025.3569941.png)
摘要
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作为病理全切片图像(WSI)分类的主流方法,多重实例学习(MIL)方法在有限的标注WSI数据上面临挑战。尽管MIL通过基于伪包(pseudo-bag)的增强方法取得了显著进展,但其有效性常受噪声伪标签和低质量伪包的限制。为克服这些问题,我们重新审视了利用伪包进行WSI数据增强的方法,并提出了一种新的伪包生成范式,命名为DPBAug。其独特特征可总结为:i)我们开发了一个单张切片内的伪包生成模块,通过表型分割将切片内的异构实例进行分离。此外,为保证生成伪包时标签的准确继承,我们提出了一个带替换的实例采样算法。ii)设计了一个跨切片伪包融合模块,用于整合多个WSI间的异构信息,生成能够更好发挥神经网络潜力的高质量训练样本。iii)伪包记忆更新模块优先保留有价值的合成伪包,进一步提升了网络的分类性能。大量实验表明,DPBAug优于现有的增强方法,提升了多个MIL基准模型在各类公开数据集上的分类性能和可靠性。DPBAug还提高了现有MIL方法的泛化能力和数据效率,促进了其在临床实践和罕见癌症研究中的应用。项目代码见:https://github.com/JiuyangDong/DPBAug。
Keyword:
Whole slide image classification
multiple instance learning
data augmentation

