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FAIR4prep: FAIR clinical informatics data preprocessing in artificial intelligence applications

delete2026-04-25
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OA
AI
M
Miriam Cobo *
A
Adriana Katherine Calapaqui Terán *
F
Fernando Aguilar *
L
L. Lloret Iglesias *
DOI:10.1038/s41597-026-07206-2delete
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摘要

摘要

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临床信息学中机器学习应用的可重复性高度依赖于数据准备。然而,预处理流程并未以系统、一致和标准化的方式报告,这限制了代码和数据集共享时的适应性和可重复性。为解决这一差距,我们提出了一套最佳实践,定义了临床信息学中报告预处理的最小化、可操作原则,并与FAIR原则(即可查找性、可访问性、可互操作性和可重用性)保持一致。我们的框架鼓励透明、一致且符合FAIR原则的数据准备步骤报告,使流程更容易理解、重用和跨研究比较。我们介绍了FAIR4prep,一种JSON-LD模式,它实现了这些最佳实践的机器可读FAIR对齐预处理。通过建立预处理文档的共享基准,本研究旨在提高可重复性、促进协作,并支持更可靠地转化为临床应用。
Keyword:
FAIR principles
clinical informatics
machine learning
data preprocessing
reproducibility
AI总结

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期刊

Scientific Data 封面图
Scientific Data
IF:
6.9
论文数:
3.7K
被引数:
3.8W

机构

U
University Hospital Marques de Valdecilla
学者数:
1
论文数: 1
被引数: 0
C
CSIC and UC
学者数:
4
论文数: 5
被引数: 0
引用论文

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