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Functional microRNA targeting without seed pairing
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AI
DOI：10.1093/nar/gkaf1018.png)
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摘要
En 中文
微小RNA (miRNAs) 与Argonaute (AGO) 蛋白结合，充当引导分子，指导其与信使RNA (mRNA) 中部分互补位点结合，最终导致转录后抑制。与miRNA种子区（miRNA第2-7个核苷酸）的互补性通常是抑制所必需且充分的。在此，我们研究了与miRNA 3'区域（第9个核苷酸及以后）具有广泛互补性但与种子区无互补性的非同寻常位点。这些仅3'位点的顶级实例结合能力与顶级规范位点相当，并能产生相似的抑制效果，这种效果可由多达2-3对额外的种子区配对进一步增强。尽管存在这些相似性，但仅3'位点的结合和解离速率比种子匹配位点更慢。它们还会赋予结合的AGO-miRNA复合物不同的构象，而种子匹配位点则不会。此外，不同miRNA在与其各自的仅3'位点结合方面的能力存在显著差异。因此，种子配对并非总是绑定和抑制所必需的，或对于靶标获得引导分子3'区域的访问权限而言也非必需。对于识别仅3'位点的miRNA而言，这些位点据估计仅占内源性靶位点的<1%，这一比例与3'-补偿位点等其他罕见但功能性位点的比例相似。
Keyword:
MAMMALIAN MICRORNAS
STRUCTURAL BASIS
RNA RECOGNITION
ARGONAUTE
GUIDE
REVEALS
DETERMINANTS
SPECIFICITY
COMPLEX
期刊
IF:
13.1
论文数:
3.6W
被引数:
29.0W
机构
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