How Binding Affinity and Binding Specificity Map to Sequence Space

doi:10.1007/s00239-026-10308-5

How Binding Affinity and Binding Specificity Map to Sequence Space

2026-03-01

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Meyer, Michelle M. *

DOI：10.1007/s00239-026-10308-5

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证据表明，分子相互作用可能对蛋白质与功能性RNA有不同的进化方式。我们提出，对于与其他核酸分子相互作用的RNA，选择高亲和力相互作用会导致更高的特异性；而对于与其他蛋白质相互作用的蛋白质，则存在亲和力与特异性之间的权衡。这种差异源于驱动分子内和分子间相互作用的分子接触的性质，其中非特异性疏水相互作用在蛋白质中驱动亲和力起关键作用，而特异性的氢键在RNA中驱动亲和力和特异性起关键作用。讨论了这种差异的影响。

Keyword:

Binding affinity

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Protein interaction

RNA interaction

Protein folding

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