Inferring cell division from cell shape

doi:10.1093/plcell/koag279

Inferring cell division from cell shape

2026-09-15

0

OA

AI

DOI：10.1093/plcell/koag279

原文链接

原文求助

摘要

En 中文

细胞分裂模式塑造发育中的器官，但其系统性分析因现有检测方法的技术难度而受限。本文提出一种通过静态细胞形状推断近期子细胞对的方法。尽管细胞分裂长期以来通过专家判断进行推断，但该方法的准确性很少被量化。利用拟南芥叶原基的活体成像，我们评估了7,573对相邻细胞（包括1,114对直接子细胞和6,459对非子细胞）的49个特征。简单的接点角标准正确推断出1,030对子细胞，精确度为94.1%，召回率为92.5%，而基于对称性的指数表现较差。时间分析显示，分裂后的接点角最初较高，在生长过程中下降，并受后续分裂影响，从而将子细胞对与非子细胞对区分开。该方法在独立的茎顶端分生组织活体成像数据集中也达到了98.4%的精确度和97.2%的召回率。应用于拟南芥尖顶突变体rpl4d-3和两种非模式物种进一步支持其在分析不同叶片形态的分裂模式方面的潜在适用性。为社区使用，我们提供了FIJI/ImageJ和Qt基于的图形用户界面实现。总体而言，本研究定量验证了经验几何线索，并为从静态组织图像中推断子细胞对提供了实用框架。

Inferring cell division from cell shape

摘要

期刊

机构

引用论文