Learning Protein Representations with Conformational Dynamics

2026-05-05

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AI

DOI：10.1093/bioinformatics/btag254

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摘要

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蛋白质在工作时会改变形状，这些变化状态控制着结合位点是否暴露、信号是否传递以及催化是否进行。大多数蛋白质语言模型将序列与单一结构快照配对，这可能会遗漏与相互作用、定位和酶活性相关的状态依赖性特征。研究还表明，许多蛋白质会呈现多种功能相关的形状，这促使了从这种变异性中学习的方法。

Keyword:

Protein conformational dynamics

Protein language models

Structural variability

Functional states

Protein interaction