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MD
DOI:10.3390/scipharm94010020.png)
摘要
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一种全面的MD + QC方法被开发并应用于评估阿比多尔与流感病毒和SARS-CoV-2表面蛋白功能氨基酸相互作用的各种方面。确定了Arb AA(AA-Trp、Tyr、Phe和Val)复合物的空间结构、溶剂化特征和构象行为,并描述了复合物中分子间相互作用的统计情况。发现阿比多尔可以参与与芳香族氨基酸的强且持久的π-π堆积相互作用。使用显式溶剂化模型、QTAIM分析和BE与复合物键临界点总电子密度的相关性,估算了水溶液中阿比多尔和氨基酸的结合能(BE)。理论计算通过芳香族AA被阿比多尔荧光(FL)猝灭的实验研究得到验证。研究了阿比多尔盐酸盐在水溶液中的光谱-荧光性质,并确定了Arb电子激发态的发光量子产率。
Keyword:
molecular dynamics
density functional theory
arbidol
amino acids
pi-pi stacking
fluorescence
electron phototransfer
期刊
S
IF:
2.5
论文数:
51
被引数:
0
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