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MicroMIL: Graph-Based Multiple Instance Learning for Context-Aware Diagnosis with Microscopic Images
DOI:10.1007/978-3-032-04927-8_37.png)
摘要
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癌症诊断已从全切片图像(WSIs)与多重实例学习(MIL)的整合中获益匪浅,实现了组织形态的高分辨率分析。基于图的MIL(GNN-MIL)方法已作为捕获WSIs中上下文信息的有力解决方案出现,从而提高了诊断准确性。然而,WSIs需要大量的计算和基础设施资源,限制了其在资源受限环境中的可及性。传统光学显微镜提供了成本效益更高的替代方案,但将GNN-MIL应用于此类数据具有挑战性,因为存在大量的冗余图像和缺失的空间坐标,这阻碍了上下文学习。为解决这些问题,我们引入了MicroMIL,这是首个专为传统光学显微镜获取的图像设计的弱监督MIL框架。MicroMIL利用一个代表性图像提取器(RIE),采用深度聚类嵌入(DCE)和硬Gumbel-Softmax来动态减少冗余并选择代表性图像。这些图像作为图节点,通过余弦相似度计算边,无需空间坐标即可保留上下文信息。在真实结肠癌数据集和BreakHis数据集上的广泛实验表明,MicroMIL实现了最先进的性能,提高了诊断准确性和对冗余的鲁棒性。代码可在https://github.com/kimjongwoo-cell/MicroMIL获取。
Keyword:
Digital Pathology
Conventional Light Microscopes
Microscopy Images
Multiple Instance Learning
期刊
机构
引用论文
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SCIENTIFIC REPORTS
IF3.9
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