NMRhub: An NMR Data Ecosystem Spanning the Complete Data Lifecycle

报告标准的出现代表了可重复科学研究的一大进步，但重大挑战依然存在。从生成、处理、分析到发表，保存数据溯源十分困难。注释的准确性随其与定义事件的分离时间越长而降低。手动注释往往不准确或不一致。跨数据资源的联邦数据整合仍具挑战性。NMRhub的构想旨在解决这些挑战，并促进机器学习（ML）的应用以解锁潜在知识。NMRhub连接了NSF高级NMR网络（NAN）、NMRbox平台和生物磁共振数据银行（BMRB），创建了一个从仪器源头持续数据并通过公共存储，促进调查、元分析和ML的集成生态系统。NAN自动从连接的谱仪中采集数据并存储在安全档案中，解析仪器提供的元数据并将数据传输至用户NMRbox账户。NMRbox虚拟化并归档用于处理和分析的完整软件环境，提供高性能计算资源（包括对开放科学网格的访问）以及用于组装BMRB存储的工具。BMRB作为世界蛋白质数据银行（wwPDB）的核心档案，对各类生物分子NMR数据进行整理、注释并提供持久标识符。NMRhub在构成平台间提供单点登录、增强ML的跨三平台资产搜索（以及跨外部资源如PubMed、领域特定YouTube频道、资助数据库），以及用于链接资源间数据传输的工具。NMRhub生态系统覆盖完整的NMR数据生命周期。（c）2026年由Elsevier Ltd出版。

Keyword:

nuclear magnetic resonance

structural biology

metabolomics

biomolecular dynamics

NMRhub: An NMR Data Ecosystem Spanning the Complete Data Lifecycle

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