arrow
返回

OKEN: A Supervised Evolutionary Optimizable Dimensionality Reduction Framework for Whole Slide Image Classification

delete2025-08-22
delete0
PRE
AI
S
Soroush Oskouei *
A
André Pedersen
M
Marit Valla
V
Vibeke Grotnes Dale
S
Sissel Gyrid Freim Wahl
M
Mats Dehli Haugum
T
Thomas Langø
M
Maria Ramnefjell
L
Lars A. Akslen
G
Gabriel Kiss
H
Hanne Sorger
DOI:10.3390-bioengineering12070733delete
delete原文链接
delete原文求助
delete分享
delete收藏
摘要

摘要

En 中文
肺癌亚型分类是一个关键的临床步骤;然而,仅依赖H&E染色的组织病理学图像可能会带来挑战,有时需要进行额外的免疫组织化学分析才能进行确切的亚型分类。数字病理学促进了人工智能在数字组织切片自动分类中的应用。全切片图像(WSI)的自动分类通常涉及从其获取的图像块中提取特征。本研究的目标是开发一个利用可优化核的WSI分类框架,通过进化算法将WSI中每个图像块的特征编码到期望且可调整的潜在空间中。编码后的数据随后可用于分类和分割,同时计算效率更高。我们提出的框架与当前最先进的模型Vim4Path在内部和外部肺癌WSI数据集上进行了比较。在内部测试集上,所提出的模型在×2.5和×10放大倍率下均优于Vim-S16,其中×2.5放大倍率下准确率最高(0.833),F1分数最高(0.721)。在外部测试集上,×10放大倍率下的Vim-S16达到最高准确率(0.732),而×2.5放大倍率下的OKEN-DenseNet121具有最佳F1分数(0.772)。未来工作中,寻找一种动态调整进化算法输出维度的方式将具有价值。
Keyword:
lung cancer subtyping
digital pathology
whole slide images
evolutionary algorithm
feature encoding

期刊

B
Bioengineering
IF:
3.7
论文数:
5.9K
被引数:
1.3W

机构

U
university of bergen
学者数:
2.0W
论文数: 1.7W
被引数: 19
T
trondheim university hospital
学者数:
72
论文数: 34
被引数: 0
D
Department of Health Research
学者数:
40
论文数: 29
被引数: 85
学者 查看更多机构
引用论文

引用论文

Emerging Properties in Self-Supervised Vision Transformers自监督视觉变换器中的新兴特性
err2021-10-01
err0
errOAAI
errMathilde Caron; Hugo Touvron; Ishan Misra; Herve Jegou; Julien Mairal; Piotr Bojanowski; Armand Joulin
err分享
err收藏
Transformers in Vision: A Survey视觉中的变形金刚: 一项调查
err2022-09-13
err1.1K
errOAAI
errKhan, Salman; Naseer, Muzammal; Hayat, Munawar; Zamir, Syed Waqas; Khan, Fahad Shahbaz; Shah, Mubarak
err分享
err收藏
Toward a Shared Vision for Cancer Genomic Data迈向癌症基因组数据的共同愿景
err2016-09-22
err1.2K
errOAAI
errGrossman, Robert L.; Heath, Allison P.; Ferretti, Vincent; Varmus, Harold E.; Lowy, Douglas R.; Kibbe, Warren A.; Staudt, Louis M.
err分享
err收藏
Data-efficient and weakly supervised computational pathology on whole-slide images全载玻片图像上的数据高效和弱监督计算病理学
err2021-03-01
err733
errOAAI
errLu, Ming Y.; Williamson, Drew F. K.; Chen, Tiffany Y.; Chen, Richard J.; Barbieri, Matteo; Mahmood, Faisal
err分享
err收藏
Multiple instance learning: A survey of problem characteristics and applications多实例学习: 问题特征与应用综述
err2018-05-01
err434
errOAAI
errCarbonneau, Marc-Andre; Cheplygina, Veronika; Granger, Eric; Gagnon, Ghyslain
err分享
err收藏
学者 查看更多内容