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OKEN: A Supervised Evolutionary Optimizable Dimensionality Reduction Framework for Whole Slide Image Classification
DOI:10.3390-bioengineering12070733.png)
摘要
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肺癌亚型分类是一个关键的临床步骤;然而,仅依赖H&E染色的组织病理学图像可能会带来挑战,有时需要进行额外的免疫组织化学分析才能进行确切的亚型分类。数字病理学促进了人工智能在数字组织切片自动分类中的应用。全切片图像(WSI)的自动分类通常涉及从其获取的图像块中提取特征。本研究的目标是开发一个利用可优化核的WSI分类框架,通过进化算法将WSI中每个图像块的特征编码到期望且可调整的潜在空间中。编码后的数据随后可用于分类和分割,同时计算效率更高。我们提出的框架与当前最先进的模型Vim4Path在内部和外部肺癌WSI数据集上进行了比较。在内部测试集上,所提出的模型在×2.5和×10放大倍率下均优于Vim-S16,其中×2.5放大倍率下准确率最高(0.833),F1分数最高(0.721)。在外部测试集上,×10放大倍率下的Vim-S16达到最高准确率(0.732),而×2.5放大倍率下的OKEN-DenseNet121具有最佳F1分数(0.772)。未来工作中,寻找一种动态调整进化算法输出维度的方式将具有价值。
Keyword:
lung cancer subtyping
digital pathology
whole slide images
evolutionary algorithm
feature encoding
期刊
B
IF:
3.7
论文数:
5.9K
被引数:
1.3W
机构
引用论文
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