.png){kind=icon}
返回
Orchestrating neuroimaging data processing using the ‘Snakemake’ workflow manager
.png){kind=icon}
OA
AI
DOI：10.1007/s00429-026-03189-3.png)
.png){kind=icon}
原文求助.png){kind=icon}
分享.png){kind=icon}
收藏
摘要
En 中文
神经影像数据处理通常涉及一套复杂的操作，这些操作往往需要不同的软件包，并且具有密集的计算和存储需求。尽管神经影像研究者有多种选择来建立其偏好的处理操作集，但关于如何在协调一致的数据处理工作流中编排这些操作的指导相对较少。本文通过描述简化神经影像处理工作流的构建，展示了通用的流程管理器“Snakemake”如何用于促进神经影像数据处理。Snakemake允许研究者使用基于Python的标记语言来描述输入文件如何转换为输出文件。随后，Snakemake利用这些规则来调度和执行生成输出文件所需的计算任务，避免不必要的重复生成现有输出文件。这使得完整处理工作流可通过单个命令执行，并创建出可解释、高效且可重复的工作流。
Keyword:
Workflow
Data processing
Data analysis
Infrastructure
Computing
期刊
B
IF:
2.9
论文数:
43
被引数:
0