.png){kind=icon}
返回
PHA synthase variant design using a conditional variational autoencoder
.png){kind=icon}
PRE
AI
DOI：10.1371/journal.pcbi.1014087.png)
.png){kind=icon}
原文求助.png){kind=icon}
分享.png){kind=icon}
收藏
摘要
En 中文
聚羟基脂肪酸酯（PHA）合成酶是一类复杂的二聚体酶，可催化R-羟基酸聚合成PHA。PHA的性质取决于其单体组成，但自然界中的酶仅对特定的R-羟基酸具有有限的特异性。本研究首次使用条件变分自编码器设计新型PHA合成酶。该模型使用从UniProt获取的天然蛋白质序列进行训练，并用于创建约10 000种新型PHA合成酶。其中16个序列被选用于体内验证。选择标准包括保守残基的存在（如催化氨基酸和二聚界面上的氨基酸）以及结构特征（如酶N端部分的α螺旋数量）。在16种新型PHA合成酶中，与最相似天然酶相比具有大量氨基酸替换（87和98个）的2种被证实具有活性，并在酵母S. cerevisiae中表达时产生聚(3-羟基丁酸)（PHB）。结果表明，基于AI的方法在创建高度复杂的二聚酶活性变体方面具有潜力。
Keyword:
SACCHAROMYCES-CEREVISIAE
PROTEIN
ACID
QUANTIFICATION
期刊
P
IF:
3.6
论文数:
638
被引数:
0
机构
引用论文
暂无论文信息