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Polysaccharide quantification using microbial enzyme cocktails
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AI
DOI：10.1093/biomethods/bpaf014.png)
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摘要
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多糖定量在理解微生物、植物和动物中的生态与营养过程方面发挥着关键作用。传统方法通常采用化学方法将这些大分子水解为单体，但这些方法并非适用于所有多糖。酶解是一种有前景的替代方案，但通常需要使用经过表征的重组酶或分泌酶的经过表征的微生物分离株。本研究中，我们介绍了一种通用方法，该方法利用个体微生物或复杂环境微生物群落分泌的未定酶混合物来水解多糖。我们以胶体几丁质和 laminarin 作为具有生态相关性的代表性多糖进行研究。结果表明，胶体几丁质可通过源自几丁质降解菌 Psychromonas sp. 分离株的酶混合物有效消化。采用 3,5-二硝基水杨酸还原糖测定法或液相色谱-质谱法检测单体和寡聚体，我们成功测定了几丁质浓度低至 62 和 15 mg/L。这实现了对微生物几丁质降解的有效监测。为扩展该方法的应用性，我们还利用复杂的、未定微生物群落作为酶混合物的来源，以降解 laminarin。通过此方法，我们通过还原糖测定法实现了 30 mg/L 的 laminarin 检测限。我们的发现强调了利用来自个体微生物以及特别是未定微生物群落的酶混合物进行多糖定量的潜力。这一进展解决了与传统的化学水解方法相关的局限性。
Keyword:
polysaccharide
chitin
laminarin
enzyme assay
