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高效薄层色谱法具有高通量分离的高基质耐受性等有利特性。然而,样品制备有时需要控制特定的基质干扰并提高目标化合物的可检测性。当代应用的趋势已从吸光度和荧光检测转向采用生物测定和质谱法的方法。传统方法(如摇瓶法、回流加热、索氏提取和水中蒸馏)正受到自动化仪器方法(如超声辅助和微波辅助溶剂萃取、加压液体萃取和超临界流体萃取)以及快速、简便、廉价、高效、耐用且安全的萃取方法的挑战,以实现更快速、更简化的样品处理。液-液萃取仍然是样品净化的最广泛应用方法,但固相萃取的竞争日益激烈。平面固相萃取的层内样品净化正越来越多地用于复杂样品,并与心脏切割多模式系统结合使用。自动喷洒式样品涂布器、洗脱头接口、目标和非目标化合物的生物检测以及直接的质谱检测被强调为当前兴趣点的主要因素,这些因素推动着更快速、更简单的样品工作流程,更复杂样品的分析以及对需要高浓缩因子的微量污染物的测定。
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