SpaBiT: enhancing spatial transcriptomics resolution via bidirectional attention transformers

2026-07-02

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DOI：10.1093/bioinformatics/btag443

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摘要

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空间转录组学（STs）能够实现基因表达在组织结构内的精确映射，然而其应用常因空间分辨率低和采样稀疏而受限。虽然现有的深度学习方法利用组织学图像、空间坐标或低分辨率表达数据来预测高密度表达谱，但这些方法要么难以捕捉组织学背景与空间拓扑之间的内在约束，要么忽略了点与点之间复杂的局部邻域关系。