arrow
返回

Stereochemistry-aware string-based molecular generation

delete2025-11-01
delete0
delete
OA
AI
G
Gary Tom
E
Edwin Yu
N
Naruki Yoshikawa
K
Kjell Jorner *
A
Alán Aspuru‐Guzik *
DOI:10.1093/pnasnexus/pgaf329delete
delete原文链接
delete分享
delete收藏
查看原文
摘要

摘要

En 中文
本研究探讨了整合立体化学信息对分子生成建模的影响,立体化学信息是计算药物发现和材料设计的核心要素。我们详细比较了基于字符串的立体化学感知与常规非立体化学感知生成方法,并应用了遗传算法和基于强化学习的技术。为评估这些模型,我们引入了新型基准测试,专门用于评估立体化学感知生成建模的重要性。结果表明,在多种立体化学敏感任务中,立体化学感知模型通常与常规算法表现相当或更优。然而,我们也观察到,在立体化学作用不显著的场景下,立体化学感知模型可能因需处理更复杂的化学空间而面临挑战。本研究为在分子生成模型中整合立体化学信息所涉及的权衡提供了见解,并针对具体应用需求选择合适方法提供了指导。
Keyword:
molecular generation
stereochemistry
generative modeling
drug design
machine learning
AI总结

AI总结

对已上传原文的论文进行重点信息的提取,主要内容包括:简要概述、研究摘要、背景介绍、关键亮点、图文解析、展望与总结。

期刊

P
PNAS Nexus
IF:
3.8
论文数:
2.2K
被引数:
3.2K

机构

V
Vector Institute for Artificial Intelligence
学者数:
217
论文数: 164
被引数: 4
U
university of toronto
学者数:
14.8W
论文数: 12.0W
被引数: 165
引用论文

引用论文

err分享
err收藏
Accurate Machine Learning Prediction of Protein Circular Dichroism Spectra with Embedded Density Descriptors嵌入密度描述符的蛋白质圆二色光谱的精确机器学习预测
errJACS AU
IF8.7
err2021-11-25
err20
errOAAI
errZhao, Luyuan; Zhang, Jinxiao; Zhang, Yaolong; Ye, Sheng; Zhang, Guozhen; Chen, Xin; Jiang, Bin; Jiang, Jun
err分享
err收藏
Molecular Assays Simulator to Unravel Predictors Hacking in Goal-Directed Molecular Generations
err2023-06-22
err1
PREAI
errGendreau, Philippe; Turk, Joseph-Andre; Drizard, Nicolas; da Silva, Vinicius Barros Ribeiro; Descamps, Clarisse; Gaston-Mathe, Yann
err分享
err收藏
Variational autoencoder-based chemical latent space for large molecular structures with 3D complexity具有3D复杂性的大分子结构的基于变分自动编码器的化学潜空间
err2023-11-16
err12
errOAAI
errOchiai, Toshiki; Inukai, Tensei; Akiyama, Manato; Furui, Kairi; Ohue, Masahito; Matsumori, Nobuaki; Inuki, Shinsuke; Uesugi, Motonari; Sunazuka, Toshiaki; Kikuchi, Kazuya; Kakeya, Hideaki; Sakakibara, Yasubumi
err分享
err收藏
DOCKSTRING: Easy Molecular Docking Yields Better Benchmarks for Ligand Design
err2022-07-18
err49
errOAAI
errGarcia-Ortegon, Miguel; Simm, Gregor N. C.; Tripp, Austin J.; Hernandez-Lobato, Jose Miguel; Bender, Andreas; Bacallado, Sergio
err分享
err收藏
The influence of stereochemistry on the reactivity of the Diels–Alder cycloaddition and the implications for reversible network polymerization
err2019-01-01
err0
errOAAI
errAudrey Cuvellier; Robrecht Verhelle; Joost Brancart; Bram Vanderborght; Guy Van Assche; Hubert Rahier
err分享
err收藏
Optimization of Molecules via Deep Reinforcement Learning通过深度强化学习优化分子
err2019-07-24
err367
errOAAI
errZhou, Zhenpeng; Kearnes, Steven; Li, Li; Zare, Richard N.; Riley, Patrick
err分享
err收藏
学者 查看更多内容