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String Consensus Problems with Swaps and Substitutions
DOI:10.1007/978-3-032-05228-5_12.png)
摘要
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字符串一致性问题旨在寻找一个字符串,使其相对于输入字符串集合的给定距离最小化。具体而言,在最近字符串问题中,给定一组等长字符串和一个半径dd。目标是找到一个新字符串,使其与每个输入字符串的差异最多为dd次替换。我们研究了该问题的一个推广,其中除了替换外,还允许相邻字符的交换,每次操作均产生单位成本。Amir等人证明了,即使仅允许交换操作,该推广问题也是NP难的。在本文中,我们证明该问题关于参数dd是固定参数可解的。此外,我们研究了一个变体,其中目标是最小化输出字符串到所有输入字符串的距离之和。对于此版本,我们提出了一种多项式时间算法。
Keyword:
Closest String
Parameterized Algorithms
Swap Distances
String Consensus

