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Subcellular level spatial transcriptomics with PHOTON
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DOI：10.1038/s41467-025-59801-3.png)
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摘要
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亚细胞定位与RNA的功能密切相关。许多RNA种类被分配到细胞器和其他亚细胞区室中，用于储存、加工、翻译或降解。因此，捕获RNA的亚细胞空间分布将直接有助于理解RNA的功能和调控。在此，我们介绍了PHOTON方法，该方法结合高分辨率成像与高通量测序，以实现亚细胞分辨率的时空转录组分析。我们证明了PHOTON是一种多功能工具，能够准确捕获目标细胞类型在组织层面的原位转录组，如卵巢中的颗粒细胞，以及亚细胞区室内的RNA含量，如核仁、线粒体和应激颗粒。利用PHOTON，我们还揭示了m6A修饰在mRNA分配至应激颗粒中的功能作用。这些结果共同表明，PHOTON是通过转录组学视角理解亚细胞分子动态的灵活且普适性的平台。
Keyword:
STRESS GRANULES
RNA
PRINCIPLES
REVEALS
期刊
IF:
15.7
论文数:
9.4W
被引数:
91.2W
机构
暂无机构信息
引用论文
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