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Systems approaches for optimizing CO2 fixation pathways
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AI
DOI：10.1016/j.copbio.2026.103551.png)
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摘要
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综述了近期关于CO2固定途径的设计与实现的研究。我们阐述了这些研究如何揭示了一条设计良好的途径与一个高产的菌株之间的差距。这一差距包括在设计中通常未被考虑的现象，例如隐藏的酶能效使用和适应性进化过程中的调控重连。多种系统生物学工具有助于弥合这一差距。可以使用新算法快速生成动力学模型，并将其与逆生物合成结合，以评估在原代网络背景下的途径动力学和稳定性。定量与相互作用蛋白质组学揭示了宿主菌株如何适应新途径，并能识别原代代谢物的干扰。适应性实验室进化被广泛用于优化模块或整个途径，但需要将途径表型与生长联系起来。后进化表征显示，细胞通过大量蛋白质组重分配来优化途径整合。
