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Toward Environment-Sensitive Molecular Inference via Mixed Integer Linear Programming
DOI:10.1021/acsomega.5c02319.png)
摘要
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传统QSAR/QSPR和反向QSAR/QSPR方法通常假设化学性质由单个分子决定,忽略了多体分子相互作用和环境因素的影响。在本文中,我们介绍了一种新颖的反向QSAR/QSPR框架,该框架能够捕捉多个相互作用分子(例如小分子或聚合物)和实验条件对性质值的综合影响。据我们所知,这是首个基于机器学习的反向QSAR/QSPR框架,能够显式地整合多个相互作用分子和环境因素。我们设计了一个特征函数,以整合多个相互作用分子和环境的信息。具体而言,针对表征溶质与溶剂之间热力学性质的Flory-Huggins chi参数(该参数随温度变化),我们通过计算实验结果证明,与现有工作相比,在预测chi参数值方面,我们的方法能够实现具有竞争力的高学习性能,同时能够在相对较短的时间内推断出单体形式中最多含有50个非氢原子的溶质聚合物。与模拟软件J-OCTA的比较研究表明,由我们方法推断的聚合物具有高质量。所有已实现的源代码可在https://github.com/ku-dml/mol-infer/tree/master/chi-parameter获得。
Keyword:
STRUCTURE GENERATION
DESIGN
QSPR
期刊
IF:
4.3
论文数:
3.4W
被引数:
9.8W
机构
引用论文
Molecular generative model based on conditional variational autoencoder for de novo molecular design
Multitask Machine Learning to Predict Polymer-Solvent Miscibility Using Flory-Huggins Interaction Parameters使用flory-huggins相互作用参数预测聚合物-溶剂混溶性的多任务机器学习
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