arrow
返回

Toward Environment-Sensitive Molecular Inference via Mixed Integer Linear Programming

delete2025-09-01
delete0
PRE
AI
D
Du, Wenjun *
M
Mao Takekida
N
Naveed Ahmed Azam
赵亮 封面图
赵亮 (Liang Zhao)
T
Tatsuya Akutsu
DOI:10.1021/acsomega.5c02319delete
delete原文链接
delete原文求助
delete分享
delete收藏
摘要

摘要

En 中文
传统QSAR/QSPR和反向QSAR/QSPR方法通常假设化学性质由单个分子决定,忽略了多体分子相互作用和环境因素的影响。在本文中,我们介绍了一种新颖的反向QSAR/QSPR框架,该框架能够捕捉多个相互作用分子(例如小分子或聚合物)和实验条件对性质值的综合影响。据我们所知,这是首个基于机器学习的反向QSAR/QSPR框架,能够显式地整合多个相互作用分子和环境因素。我们设计了一个特征函数,以整合多个相互作用分子和环境的信息。具体而言,针对表征溶质与溶剂之间热力学性质的Flory-Huggins chi参数(该参数随温度变化),我们通过计算实验结果证明,与现有工作相比,在预测chi参数值方面,我们的方法能够实现具有竞争力的高学习性能,同时能够在相对较短的时间内推断出单体形式中最多含有50个非氢原子的溶质聚合物。与模拟软件J-OCTA的比较研究表明,由我们方法推断的聚合物具有高质量。所有已实现的源代码可在https://github.com/ku-dml/mol-infer/tree/master/chi-parameter获得。
Keyword:
STRUCTURE GENERATION
DESIGN
QSPR

期刊

ACS Omega 封面图
ACS Omega
IF:
4.3
论文数:
3.4W
被引数:
9.8W

机构

Q
Quaid I Azam University
学者数:
8.5K
论文数: 7.1K
被引数: 55
K
kyoto university
学者数:
8.1K
论文数: 3.2K
被引数: 0
引用论文

引用论文

err分享
err收藏
Multitask Machine Learning to Predict Polymer-Solvent Miscibility Using Flory-Huggins Interaction Parameters使用flory-huggins相互作用参数预测聚合物-溶剂混溶性的多任务机器学习
err2023-07-10
err21
errOAAI
errAoki, Yuta; Wu, Stephen; Tsurimoto, Teruki; Hayashi, Yoshihiro; Minami, Shunya; Tadamichi, Okubo; Shiratori, Kazuya; Yoshida, Ryo
err分享
err收藏
Application of QSPR to mixtures
err2006-07-18
err55
PREAI
errAjmani, Subhash; Rogers, Stephen C.; Barley, Mark H.; Livingstone, David J.
err分享
err收藏
err分享
err收藏
An Inverse QSAR Method Based on Decision Tree and Integer Programming
err2021-08-09
err0
PREAI
errKouki Tanaka; Jianshen Zhu; Naveed Ahmed Azam; Kazuya Haraguchi; Liang Zhao; Hiroshi Nagamochi; Tatsuya Akutsu
err分享
err收藏
Automatic Chemical Design Using a Data-Driven Continuous Representation of Molecules使用数据驱动的分子连续表示的自动化学设计
err2018-01-12
err2.5K
errOAAI
errGomez-Bombarelli, Rafael; Wei, Jennifer N.; Duvenaud, David; Hernandez-Lobato, Jose Miguel; Sanchez-Lengeling, Benjamin; Sheberla, Dennis; Aguilera-Iparraguirre, Jorge; Hirzel, Timothy D.; Adams, Ryan P.; Aspuru-Guzik, Alan
err分享
err收藏
Quadratic descriptors and reduction methods in a two-layered model for compound inference二次描述符和降维方法在用于复合推断的两层模型中
err2025-01-29
err0
errOAAI
errAzam, Naveed Ahmed; Cao, Shengjuan; Ido, Ryota; Haraguchi, Kazuya; Zhao, Liang; Nagamochi, Hiroshi; Akutsu, Tatsuya
err分享
err收藏
学者 查看更多内容