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Transformer-Based Models for Predicting Molecular Structures from Infrared Spectra Using Patch-Based Self-Attention
DOI:10.1021/acs.jpca.4c05665.png)
摘要
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红外(IR)光谱学作为一种振动光谱学,能够提供广泛的分子结构细节,是化学家确定分子结构的高效技术。然而,分析实验光谱一直具有挑战性,因为其需要专业知识,且光谱在不同实验条件下存在变异性。在此,我们提出了一种基于transformer的模型,并设计了基于分块自注意力机制的光谱嵌入层,旨在防止光谱信息的丢失,同时保持模型简洁性和有效性。为进一步提升模型对IR光谱的理解,我们引入了一种数据增强方法,该方法仅在选择性地在吸收峰处引入垂直噪声。我们的方法不仅在模拟数据集上实现了最先进的表现,还在真实实验光谱上达到了55%的top-1准确率,超越了先前最先进方法的约10%。此外,我们的模型在分析复杂且多变的指纹区域时表现出色,能够有效提取关键结构信息。
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2.8
论文数:
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