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Translation accuracy in E. coli
DOI:10.1093/nar/gkag674.png)
摘要
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翻译是生命的基本过程,但系统研究其保真度的方法有限。以往对翻译错误率的估计大多依赖报告基因检测,仅评估单个密码子,无法捕捉翻译错误的全部谱系。本研究通过对质谱数据的蛋白质组学分析,直接估计了几乎所有的氨基酸替换率,揭示了每种氨基酸和每个密码子的误译率和误译谱。将该方法应用于已知翻译保真度不同的大肠杆菌核糖体变体,发现它们之间的总错误率无显著差异,估计为每1000个氨基酸2个错误。相反,各变体表现出独特的误译谱;假定的易错变体倾向于在第三位误读近同源密码子,这种偏差可能导致先前对其错误率的过高估计。我们还检验了密码子使用的翻译准确性假说,该假说预测高表达基因中富集的密码子因翻译准确性而被选择。与该预测相反,高表达基因中偏爱的密码子并未翻译得更准确。这些结果强调了蛋白质组水平测量翻译准确性的必要性,并突显了单密码子方法在表征翻译保真度方面的局限性。
期刊
IF:
13.1
论文数:
3.6W
被引数:
29.0W
机构
暂无机构信息
引用论文
Fitness Effects of Phenotypic Mutations at Proteome-Scale Reveal Optimality of Translation Machinery

