刘晖 (Liu, Hui)
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个人简介
"刘晖,女,博士,教授,博士生导师,星联岗位教师。研究方向聚焦生物信息学、计算表观遗传学与发育生物学的交叉领域,致力于运用人工智能与深度学习技术解析遗传与表观遗传元件的协同调控机制。主要研究涉及基于深度学习构建多模态数据整合的表观遗传调控景观,系统解析DNA甲基化、组蛋白修饰和非编码RNA的协同作用机制,揭示表观遗传元件在胚胎发育和疾病发生中的动态调控规律;结合单细胞多组学数据和空间转录组技术,开发基于深度学习模型,预测表观遗传变异对肿瘤异质性和微环境重塑的影响,及表观遗传重编程在肿瘤进化过程中的驱动作用;以及表观遗传领域的高通量数据挖掘的算法和软件开发,可视化智能分析平台及数据库构建。主持国自然面上项目1项,国自然青年项目1项,黑龙江省青年项目(C类)1项,同时作为研究骨干成员参与国自然联合基金项目等多项国家自然科学基金项目。研究成果发表于《Science Advances》、《Nucleic Acids Research》、《Molecular Therapy Nucleic Acids》、《Development》等有重要国际影响的杂志上发表了多篇论文。累计发表SCI论文30余篇;其中以第一作者及通讯作者发表SCI论文10余篇,影响因子大于5的7篇。\n教学方面,主讲《计算表观遗传学》、《分子网络分析》、《药物转录组信息学》以及《组合数学与图论》等专业课及专业基础课,共承担8个轨道9门课程的教学任务,并兼职教研室教学秘书职务,获得2020年校青年教师教学风采大赛三等奖,以及2021年年度优秀教师奖励;2022年黑龙江省高等教育教学成果奖二等奖。教学资源与课程体系建设方面,担任人民卫生出版社全国高等学校智能医学工程专业规划教材《智能医学工程导论》的编委/数字资源编委,工业和信息化部“十四五”规划教材《计算生物学》数字教材编委,以及科学出版社省级规划教材《精准医学理论基础与应用》的编委,负责相关章节的编写工作。作为骨干成员参与了省级研究生精品课程《医学免疫信息学》的在线课程建设工作。主持黑龙江省高等教育教学改革研究一般项目1项,致力于探索“科教融汇、思政贯穿”的课程体系建设。\n学生培养方面,指导及协助指导博士研究生4名,硕士研究生11名及本科毕业设计20余名,指导学生获得2019年本科优秀毕业论文,并获得优秀指导教师荣誉称号;并多次指导学生获得美国数学建模竞赛国际二等奖、全国统计建模竞赛国家三等奖、全国数学建模竞赛省一等奖、及东三省数学建模竞赛省一等奖等多个奖项;指导学生参与第七届黑龙江“互联网+”大学生创新创业大赛获得银奖;指导省级创新创业项目1项,校级创新创业项目2项。\n教育经历\n2013.09-2017.07,哈尔滨工业大学,生物医学工程专业,博士\n2010.09-2013.07,哈尔滨医科大学,生物医学工程专业,硕士\n2005.09-2010.07,哈尔滨医科大学,生物技术专业,(生物信息学方向)学士\n工作经历\n2025.09-至今,哈尔滨医科大学,生物信息科学与技术学院,教授\n2020.09-2025.08,哈尔滨医科大学,生物信息科学与技术学院,副教授\n2017.09-2020.09,哈尔滨医科大学,生物信息科学与技术学院,讲师\n获奖列表\n个人和指导学生获奖\n(1)国际二等奖(指导教师),2022年,美国数学建模竞赛;\n(2)国际二等奖(指导教师),2021年,美国数学建模竞赛\n(3)国际三等奖(指导教师),2021年,美国数学建模竞赛;\n(4)国家三等奖(指导教师),2019年,全国大学生统计建模竞赛;\n(5)国家优秀奖(指导教师),2019年,全国大学生统计建模竞赛;\n(6)省一等奖(指导教师),2022年,东北三省数学建模联赛;\n(7)省一等奖(指导教师),2020年,全国大学生数学建模竞赛;\n(8)省二等奖(指导教师),2019年,全国大学生数学建模竞赛;\n(9)省一等奖(指导教师),2020年,东北三省数学建模联赛;\n(10)省二等奖(指导教师),2025年,东北三省数学建模联赛;\n(11)省三等奖(指导教师),2018年,东北三省数学建模联赛;\n(12)第四届黑龙江省搞笑教师教学创新大赛产教融合赛道三等奖,排名第3,2024年,黑龙江省教育厅;\n(13)省银奖(指导教师),2021年,第七届黑龙江“互联网+”大学生创新创业大赛;\n(14)指导教师(第1名),2023年,大学生创新训练项目省级一般项目 S20231022608;\n(15)哈尔滨医科大学青年教师教学风采大赛三等奖,2020年,哈尔滨医科大学;\n(16)校级优秀教师年度奖励,2021年;\n(17)博士研究生国家奖学金,2016年,教育部;\n(18)黑龙江省优秀硕士毕业生,2013年,黑龙江省;\n(19)硕士研究生国家奖学金,2012年,教育部。\n教学成果奖\n(1)黑龙江省高等教育教学成果奖二等奖:“科教融合、全程多元、知行合一”的生物信息学专业创新教学体系研究与实践,2022年。\n教学课题\n(1)黑龙江省高等学校教育教学改革项目一般研究项目:“科教融汇、思政贯穿”视域下的肿瘤免疫信息学课程体系平台的构建,2024年,黑龙江省教育厅,主持,在研。\n(2)黑龙江省研究生精品课程建设项目《肿瘤免疫信息学》;黑龙江省教育厅,主要参与人。\n(3)省研究生精品课程思政案例项目《肿瘤免疫信息学》;黑龙江省教育厅,主要参与人。\n(4)黑龙江省高等教育教学改革研究一般研究项目:基于智慧教学+CDIO理念的大学生数学建模培训实践与研究,2019年,黑龙江省教育厅,参与,结题。\n(5)思政课题“立德树人”视域下生物医学工程专业青年研究生导师育人模式探究,2023年,主要参与人\n(6)黑龙江省高等教育学会高等教育研究课题:生物信息学学科和专业协同建设与内涵式发展研究,2023年,23GJYBJ076,主要参与人\n教材建设\n(1)《智能医学工程导论》,人民卫生出版社,纸质教材编委/数字资源编委;\n(2)《计算生物学》,工业和信息化部“十四五”规划教材,数字教材编委,\n(3)《精准医学理论基础与应用》,科学出版社,省级规划教材,编委\n在研与完成科研项目(负责与参与)\n(1)国家自然科学基金面上项目:融合增强子活性的肿瘤干性评价算法开发及肿瘤异质性剖析,2023年-2026年,主持,在研;\n(2)黑龙江省自然科学基金青年项目C类:基于深度学习的肿瘤微环境功能生态型调控特征挖掘与干预预策略研究,2026年-2028年,主持,在研;\n(3)国家自然科学基金青年项目:开发整合基因组和表观基因组特征的增强子RNA精确预测方法及功能分析,2019年-2021年,主持,结题;\n(4)国家自然科学基金联合基金项目:融合多组学高通量数据识别早期结肠癌预警及诊断的肿瘤标志物,2021年-2024年,参与,结题;\n(5)优势特色学科固强增效计划少帅揭榜项目:传统中药砷剂临床诊疗的生物信息学新方法与新技术研究,2021年-2022年,参与,结题。\n(6)国家自然科学基金面上项目:Dlk1-Dio3印记区域内母本甲基化差异甲基化区Meg8 -DMR的功能研究,2018年-2021年,结题;\n(7)国家自然科学基金面上项目:碘对甲状腺乳头状癌预后转归的影响极其分子机制研究,参与,结题;\n(8)国家自然科学基金面上项目:基于高通量表观基因组图谱的癌症分子分型的系统分析,2014/01-2017/12 ,60万元,已结题,(参与)\n科研奖励情况\n(1)哈尔滨市自然科学技术学术成果奖:基于加权蛋白质互作网络优选癌症相关甲基化变异基因,优秀奖,(2012年),排名第一。"
教育背景
2013.09 – 2017.07
哈尔滨工业大学 博士 生物医学工程专业
2010.09 – 2013.07
哈尔滨医科大学 硕士 生物医学工程专业
2005.09 – 2010.07
哈尔滨医科大学 学士 生物技术专业,(生物信息学方向)
工作经历
2025.09 – 至今
哈尔滨医科大学,生物信息科学与技术学院
教授
2020.09 – 2025.08
哈尔滨医科大学,生物信息科学与技术学院
副教授
2017.09 – 2020.09
哈尔滨医科大学,生物信息科学与技术学院
讲师
荣誉奖项
- 国际二等奖(指导教师)(2022)|美国数学建模竞赛
- 国际二等奖(指导教师)(2021)|美国数学建模竞赛
- 国际三等奖(指导教师)(2021)|美国数学建模竞赛
- 国家三等奖(指导教师)(2019)|全国大学生统计建模竞赛
- 国家优秀奖(指导教师)(2019)|全国大学生统计建模竞赛
- 省一等奖(指导教师)(2022)|东北三省数学建模联赛
- 省一等奖(指导教师)(2020)|全国大学生数学建模竞赛
- 省二等奖(指导教师)(2019)|全国大学生数学建模竞赛
- 省二等奖(指导教师)(2025)|东北三省数学建模联赛
- 省三等奖(指导教师)(2018)|东北三省数学建模联赛
- 第四届黑龙江省搞笑教师教学创新大赛产教融合赛道三等奖,排名第3(2024)|黑龙江省教育厅
- 省银奖(指导教师)(2021)|第七届黑龙江“互联网+”大学生创新创业大赛
- 指导教师(第1名)(2023)|大学生创新训练项目省级一般项目 S20231022608
- 哈尔滨医科大学青年教师教学风采大赛三等奖(2020)|哈尔滨医科大学
- 校级优秀教师年度奖励(2021)
- 博士研究生国家奖学金(2016)|教育部
- 黑龙江省优秀硕士毕业生(2013)|黑龙江省
- 硕士研究生国家奖学金(2012)|教育部
- 黑龙江省高等教育教学成果奖二等奖:“科教融合、全程多元、知行合一”的生物信息学专业创新教学体系研究与实践(2022)
- 哈尔滨市自然科学技术学术成果奖:基于加权蛋白质互作网络优选癌症相关甲基化变异基因(2012)|哈尔滨市

