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BL-FlowSOM: Consistent and Highly Accelerated FlowSOM Based on Parallelized Batch Learning

delete2025-04-17
delete0
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OA
AI
F
Fumitaka Otsuka *
K
Kenji Yamane
K
Koji Futamura
J
Junichiro Enoki
Y
Yuji Nishimaki
Y
Yoshiki Tanaka
H
Higuchi, Akihide
M
Motohiro Furuki
DOI:10.1002/cyto.a.24934delete
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摘要

摘要

En 中文
流式细胞术数据维度的近期增加推动了各种计算分析方法的开发。FlowSOM 是性能最佳的聚类方法之一,但在聚类过程的一致性和速度方面仍有改进空间。在此,我们介绍了批学习 FlowSOM(BL-FlowSOM),这是一种基于并行批学习的、具有一致性和高度加速的 FlowSOM。将学习算法从在线学习更改为以主成分分析初始化的批学习,提高了聚类过程的一致性并消除了其中的随机性。它还使学习过程能够并行化,从而在聚类质量与 FlowSOM 相当的情况下,显著加速聚类过程。BL-FlowSOM 可在 Sony 的 Spectral Flow Analysis(SFA)-Life sciences 云平台上获取()。
Keyword:
batch learning
computational cytometry
high-dimensional flow cytometry
parallelization
self-organizing map
spectral flow cytometry
unsupervised clustering
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