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BL-FlowSOM: Consistent and Highly Accelerated FlowSOM Based on Parallelized Batch Learning
DOI:10.1002/cyto.a.24934.png)
摘要
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流式细胞术数据维度的近期增加推动了各种计算分析方法的开发。FlowSOM 是性能最佳的聚类方法之一,但在聚类过程的一致性和速度方面仍有改进空间。在此,我们介绍了批学习 FlowSOM(BL-FlowSOM),这是一种基于并行批学习的、具有一致性和高度加速的 FlowSOM。将学习算法从在线学习更改为以主成分分析初始化的批学习,提高了聚类过程的一致性并消除了其中的随机性。它还使学习过程能够并行化,从而在聚类质量与 FlowSOM 相当的情况下,显著加速聚类过程。BL-FlowSOM 可在 Sony 的 Spectral Flow Analysis(SFA)-Life sciences 云平台上获取()。
Keyword:
batch learning
computational cytometry
high-dimensional flow cytometry
parallelization
self-organizing map
spectral flow cytometry
unsupervised clustering
AI总结
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期刊
IF:
2.1
论文数:
120
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5.2K
机构
引用论文
Analysis of codon usage diversity of bacterial genes with a self-organizing map (SOM): characterization of horizontally transferred genes with emphasis on the E. coli O157 genome用自组织图谱 (SOM) 分析细菌基因的密码子使用多样性: 水平转移基因的表征,重点是大肠杆菌O157基因组
Gene
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