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Continuous cell-type diversification in mouse visual cortex development
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OA
AI
DOI：10.1038/s41586-025-09644-1.png)
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摘要
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哺乳动物皮层由高度多样化的细胞类型组成，并通过一系列时间调控事件发育而成¹⁻³。单细胞转录组学使得能够对整个皮层发育时间线上的细胞类型进行系统性研究。本文呈现了一个全面且高分辨率的发育小鼠视觉皮层转录组学和表观基因组学细胞类型图谱。该图谱基于包含568,654个高质量单细胞转录组和200,061个高质量单核Multiome数据集构建，这些数据在胚胎和出生后发育阶段（从胚胎发育第11.5天至出生后第56天）进行了密集采样。我们通过计算重建了视觉皮层中所有兴奋性、抑制性和非神经元细胞类型的转录组学发育轨迹图。识别出标记特定发育年龄上新细胞类型出现的分支点以及细胞分化的分子特征。轨迹图显示，胚胎阶段的神经发生、胶质发生和早期出生后有丝分裂后的成熟以交错并行的方式产生了所有细胞类别和几乎所有亚类。在出生后分化过程中逐渐出现更精细的细胞类型，包括在睁眼阶段和关键期开始时许多细胞类型的晚期出现，表明皮层发育的不同阶段存在持续的细胞类型多样化。在整个发育过程中，特定细胞类型的基因表达和染色质可及性存在协同动态变化。我们识别出细胞类型特异性和时间分辨的基因调控网络，这些网络通过可及染色质基序将转录因子与下游靶基因联系起来。总体而言，本研究提供了一个详细的动态分子图谱，该图谱与个体细胞类型和特定时间事件直接相关，能够揭示复杂且多方面的皮层细胞类型和回路发育背后的分子逻辑。从胚胎到出生后发育的高分辨率转录组学和表观基因组学细胞类型图谱被呈现，为与个体细胞类型和特定发育事件相关的实时动态分子图谱提供了支持。
Keyword:
cell-type diversification
transcriptomic atlas
epigenomic profiling
cortical development
gene regulatory networks
AI总结
对已上传原文的论文进行重点信息的提取，主要内容包括：简要概述、研究摘要、背景介绍、关键亮点、图文解析、展望与总结。
