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CTCF-RNA interactions orchestrate cell-specific chromatin loop organization
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AI
DOI：10.1126/sciadv.ady5507.png)
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摘要
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CCCTC结合因子（CTCF）对染色质组织至关重要。CTCF与内源性RNA相互作用，其ZF1 RNA结合区域（ΔZF1）的缺失会破坏小鼠胚胎干细胞（ESCs）中的染色质环。然而，在细胞分化过程中CTCF-ZF1与RNA相互作用的生物学意义尚不清楚。我们采用ESC向神经祖细胞（NPC）分化的模型，证明CTCF-ZF1对于维持细胞类型特异的染色质环至关重要。CTCF-ΔZF1的表达导致染色质环破坏以及环内基因表达失调，尤其是那些参与神经元发育和功能的基因。我们鉴定出NPC特异性的、与CTCF-ZF1相互作用的RNA。两种编码RNA Podxl和Grb10的截短体破坏了同源染色质环，这与在表达CTCF-ΔZF1的NPCs中观察到的破坏类似。这些发现强调了CTCF-ZF1与RNA相互作用在维持细胞特异基因组结构和细胞身份方面的内在重要性。
期刊
IF:
12.5
论文数:
2.1W
被引数:
18.1W
机构
引用论文
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