.png){kind=icon}
返回
Decoding epithelial–mesenchymal transitions with multi-omics
.png){kind=icon}
PRE
AI
DOI：10.1038/s41576-026-01015-4.png)
.png){kind=icon}
原文求助.png){kind=icon}
分享.png){kind=icon}
收藏
摘要
En 中文
上皮-间质转化（EMT）是一种高度动态且可塑的细胞程序，对胚胎发育、组织修复和衰老至关重要，并且在癌症和纤维化等病理条件下被利用。EMT的特征是中间状态的连续性和显著的细胞异质性，这历史上限制了跨转录组、表观基因组、蛋白质组和代谢组等调控层的系统性研究。高通量组学技术的最新进展，特别是单细胞和空间分辨平台，使细胞状态的全面表征得以在前所未有的分辨率下实现。这些方法与机器学习框架、基于网络的建模和整合多组学等计算方法相结合，对于从本质上复杂的 datasets 中提取生物学见解至关重要。在本综述中，我们讨论新兴组学技术与计算框架的融合如何推动了EMT研究，概述关键的分析考虑因素，并讨论当前挑战和未来在生物标志物发现和转化应用方面的机遇。上皮-间质转化（EMT）是一种动态的细胞状态转变，支持胚胎发育、组织修复和衰老，并且常被疾病利用。在本综述中，Narwade和Nieto讨论了单细胞、空间和整合多组学方法，以及计算框架如何揭示EMT的异质性、轨迹、机制和转化机遇。
期刊
IF:
52
论文数:
4.0K
被引数:
4.3W
机构
引用论文
STAN, a computational framework for inferring spatially informed transcription factor activitySTAN：一种用于推断空间信息转录因子活性的计算框架.png)
Nucleic Acids Research
Nucleic Acids ResearchIF13.1
PREAI
分享收藏Spatial profiling technologies illuminate the tumor microenvironment空间分析技术照亮了肿瘤微环境Cancer Cell
OAAI
Cancer CellIF0
OAAI分享收藏
The epithelial-mesenchymal plasticity landscape: principles of design and mechanisms of regulation上皮-间充质可塑性景观: 设计原理和调节机制
PREAI
分享收藏Slingshot: cell lineage and pseudotime inference for single-cell transcriptomics弹弓: 单细胞转录组学的细胞谱系和伪时间推断BMC GENOMICSOAAI
BMC GENOMICSIF3.7
OAAI分享收藏Identification of spatial expression trends in single-cell gene expression data单细胞基因表达数据中空间表达趋势的识别NATURE METHODSOAAI
NATURE METHODSIF32.1
OAAI分享收藏分享收藏A single-cell and spatially resolved atlas of human breast cancers人类乳腺癌的单细胞和空间分辨图谱NATURE GENETICSOAAI
NATURE GENETICSIF31.8
OAAI分享收藏
查看更多内容