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Differential detection workflows for multi-sample single-cell RNA-seq data
DOI:10.1186/s12864-025-12102-x.png)
摘要
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在单细胞转录组学中,差异表达(DE)工具比较不同细胞类型或条件下的平均表达量。然而,scRNA-seq技术有望推断表达分布其他方面的差异。因此,我们开发了差异检测(DD)工作流程,用于推断表达被检测到的细胞平均比例的差异。在评估了八种DD策略后,我们提出了一种统一的工作流程,用于联合评估DE和DD。通过模拟和两个案例研究,我们证明我们的联合分析在报告的个体基因及其功能解释方面均能提供互补信息。
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