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Improved Approximation Algorithm and Hardness Result for Sorting Unsigned Strings by Symmetric Reversals

delete2026-01-01
delete0
PRE
AI
W
Wenfeng Lai
姜海涛 封面图
姜海涛 (Haitao Jiang) *
朱
朱大铭 (Daming Zhu)
Z
Zhu, Binhai
DOI:10.1007/978-981-95-0218-9_25delete
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摘要

摘要

En 中文
结构变异被广泛认为是遗传变异的重要来源。作为结构变异的一种已知类型,反转被生物学家和计算机科学家广泛研究。最近,科学家发现染色体上发生反转的片段末端通常出现重复序列,这激发了对于无符号染色体对称反转排序模型(简称MUSR)的新兴趣。MUSR问题要求找到将染色体S转换为染色体T所需的最少无符号对称反转次数,并要求对称反转操作在由相同字母界定的片段上进行。本文通过从MAX-(3,B2)-SAT问题进行复杂归约,证明了MUSR问题是NP难的。此外,我们提供了最优解的创新性描述,并开发了一种改进的近似算法,确保近似比为2 ln3+7/8(约1.15),时间复杂度为O(n²)。
Keyword:
Symmetric reversals
Approximation algorithms
NP-hard

期刊

C
COMPUTING AND COMBINATORICS, COCOON 2025, PT II
IF:
0
论文数:
24
被引数:
0

机构

S
shandong university
学者数:
9.5W
论文数: 6.4W
被引数: 94
M
Montana State University System
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