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Investigating RNA dynamics from single molecule transcriptomes
DOI:10.1016/j.tig.2025.05.001.png)
摘要
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长读长测序技术,如Pacific Biosciences(PacBio)和Oxford Nanopore Technologies,通过在单分子分辨率下直接检测转录异构体、多聚(A)尾和RNA修饰动态,彻底改变了RNA研究。用于研究多种RNA模态及其相关数据流的实验方案进展,推动了新一代计算工具的发展。计算工具的最新进展使得能够在模型系统和疾病状态下对RNA代谢进行高通量研究。高通量、第三代测序技术的出现,特别是ONT,在不对RNA原始状态造成破坏的情况下,革新了RNA修饰检测。
Keyword:
long-read sequencing
RNA modification detection
transcript isoforms
poly(A) tails
third-generation sequencing
期刊
IF:
16.3
论文数:
3.4K
被引数:
1.5W
机构
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