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Optimized protein extraction protocol from human skin samples
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AI
DOI：10.1093/biomethods/bpaf035.png)
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摘要
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皮肤是人体最大的器官，也是多种疾病的发生部位。然而，由于皮肤组织的复杂性，文献中关于皮肤蛋白质组学的数据有限。在此，我们提出了一种改良且优化的蛋白质提取方案，结合化学和机械裂解方法从人体皮肤中提取蛋白质。为此，我们使用了含2% SDS、50 mM TEAB以及1%蛋白酶和磷酸酶抑制剂混合物的裂解缓冲液，并辅以Matrix A珠和FastPrep-24 5G匀质仪。为表征样品，所获得的蛋白质经纯化并用SP3方法（单锅固相样品制备）进行酶解，随后通过纳升液相色谱-串联质谱进行分析。通过这种方法，我们在健康个体及孢子丝菌病真菌感染患者的皮肤样本中鉴定出约6000种蛋白质。我们的改进方法有望显著加深对皮肤生物学的理解，并为皮肤疾病的生物标志物和 therapeutic targets 的发现提供新视角。
Keyword:
skin
proteomics
extraction of proteins
protocol
mass spectrometry
AI总结
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期刊
B
IF:
1.3
论文数:
61
被引数:
0
机构
引用论文
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