返回
Post-polyploidization centromere evolution in cotton
DOI:10.1038/s41588-025-02115-3.png)
摘要
En 中文
陆地棉(Gossypium hirsutum)占全球棉花产量的90%以上,作为一种异源四倍体,是研究多倍体作物驯化的模式植物。在本研究中,我们报道了陆地棉品系Texas Marker-1(TM-1)的端粒到端粒(T2T)基因组组装结果(T2T-TM-1),其总大小为2,299.6 Mb,并注释了79,642个基因。基于T2T-TM-1,检测到A亚基因组与D亚基因组及其对应的二倍体亲本之间的种间着丝粒分化。着丝粒相关重复序列(CRCs)被发现富集于Gypsy-like反转录转座子。多倍体化后发生了着丝粒大小扩张、重定位和结构变异。有趣的是,CRC同源序列从二倍体D基因组亲本转移至D亚基因组,随后侵入A亚基因组,并在多倍体化后发生增殖。这表明D基因组亲本的CRCs具有进化优势,提出了多倍体化后D基因组特有的着丝粒重复序列遗传模式,并塑造了多倍体物种在多倍体化过程中的动态着丝粒景观。
Keyword:
READ ALIGNMENT
GENOME
SEQUENCE
GENES
RETROTRANSPOSONS
PREDICTION
PROVIDES
期刊
IF:
29
论文数:
758
被引数:
241
机构
暂无机构信息
引用论文
Comparative Genome Analyses Highlight Transposon-Mediated Genome Expansion and the Evolutionary Architecture of 3D Genomic Folding in Cotton比较基因组分析突出了转座子介导的棉花基因组扩展和3D基因组折叠的进化结构
Telomere-to-telomere and haplotype-resolved genome of the kiwifruit Actinidia eriantha猕猴桃猕猴桃的端粒到端粒和单倍型分辨的基因组
A comprehensive molecular cytogenetic analysis of chromosome rearrangements in gibbons
GENOME RESEARCH
IF5.5
Wheat centromeric retrotransposons: the new ones take a major role in centromeric structure
PLANT JOURNAL
IF5.7
Whole-chromosome paints in maize reveal rearrangements, nuclear domains, and chromosomal relationships玉米中的全染色体涂料揭示了重排,核域和染色体关系

