.png){kind=icon}
返回
Single-cell spatial (scs) omics: Recent developments in data analysis
.png){kind=icon}
PRE
AI
DOI：10.1016/j.trac.2024.118109.png)
.png){kind=icon}
.png){kind=icon}
分享.png){kind=icon}
收藏
摘要
En 中文
近年来，技术进步使得在细胞水平上测量组学数据成为可能，从而产生了一种被称为单细胞（sc）组学的新型数据。另一方面，所谓的空间组学是一类在空间域中生成生物信息的技术，例如在组织体积中。在本综述中，我们主要关注单细胞与空间（scs）组学的交叉领域，以及这种新型数据对下游数据分析方法所带来的挑战和机遇。我们的目标是涵盖所有主要的组学模态，包括转录组学、基因组学、表观基因组学、蛋白质组学和代谢组学。
Keyword:
Single-cell
Spatial
Omics
Data analysis
Computational
期刊
IF:
12
论文数:
7.3K
被引数:
3.9W
机构
引用论文
Characterizing spatial gene expression heterogeneity in spatially resolved single-cell transcriptomic data with nonuniform cellular densities在具有不均匀细胞密度的空间分辨的单细胞转录组数据中表征空间基因表达异质性.png)
GENOME RESEARCH
OAAI
GENOME RESEARCHIF5.5
OAAI分享收藏Evaluation of Distance Metrics and Spatial Autocorrelation in Uniform Manifold Approximation and Projection Applied to Mass Spectrometry Imaging DataANALYTICAL CHEMISTRY
OAAI
ANALYTICAL CHEMISTRYIF6.7
OAAI分享收藏SANTO: a coarse-to-fine alignment and stitching method for spatial omicsSANTO: 一种用于空间组学的从粗到细的对齐和拼接方法NATURE COMMUNICATIONSOAAI
NATURE COMMUNICATIONSIF15.7
OAAI分享收藏Signal preprocessing, multivariate analysis and software tools for MA(LDI)-TOF mass spectrometry imaging for biological applications用于生物应用的MA(LDI)-TOF质谱成像的信号预处理、多变量分析和软件工具
PREAI
分享收藏分享收藏DNA-GPS: A theoretical framework for optics-free spatial genomics and synthesis of current methodsCELL SYSTEMSOAAI
CELL SYSTEMSIF7.7
OAAI分享收藏
查看更多内容