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Tear fluid database: a reference website for tear fluid proteomics
DOI:10.1093/database/baaf091.png)
摘要
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泪液是一种临床可获取、微创的生物体液,具有复杂且动态变化的蛋白质组。泪液成分的分子改变已被与广泛的眼睛和全身性疾病相关联;然而,泪液样本体积小给获取高质量蛋白质组数据带来了巨大挑战。为克服这一限制,我们开发了一种高灵敏度质谱工作流程,能够从单个泪液样本中鉴定出超过1,000种蛋白质。将该工作流程应用于大型且多样化的队列,我们生成了代表性且全面的人类泪液蛋白质组谱,并建立了泪液中常见检测蛋白质的参考丰度范围。在蛋白质定量分析的同时,我们收集了每位参与者的详细临床注释。随着数据库的持续增长,这些分析将越来越多地支持识别与疾病相关的蛋白质组特征,加深我们对潜在生物学机制的理解,并加速临床相关生物标志物的发现。为使这些数据广泛可用,我们创建了一个用户友好的网站,用于探索蛋白质测量结果及其相关的临床元数据。当前版本包括74份人类泪液样本的蛋白质组谱,涵盖2,134种独特蛋白质。泪液数据库作为生物标志物发现、比较蛋白质组学和泪液生物学系统水平研究的基础资源,为科学界提供了一个强大且可扩展的平台,以推动泪液蛋白质组学研究。数据库网址:https://tearfluid.org/
Keyword:
BIOMARKERS
FILM
LACTOFERRIN
期刊
D
IF:
3.6
论文数:
1.8K
被引数:
6.1K
机构
引用论文
DIA-NN: neural networks and interference correction enable deep proteome coverage in high throughputDia-nn: 神经网络和干扰校正可实现高通量的深度蛋白质组覆盖
NATURE METHODS
IF32.1
Biochemical-molecular-genetic biomarkers in the tear film, aqueous humor, and blood of primary open-angle glaucoma patients原发性开角型青光眼患者泪膜,房水和血液中的生化分子遗传生物标志物
Growth factors in the tear film: Role in tissue maintenance, wound healing, and ocular pathology
OCULAR SURFACE
IF5.6
The power of tears: how tear proteomics research could revolutionize the clinic眼泪的力量: 眼泪蛋白质组学研究如何彻底改变临床

