arrow
返回

Transcriptomic neuron types vary topographically in function and morphology

delete2025-02-12
delete4
delete
OA
AI
DOI:10.1038/s41586-024-08518-2delete
delete原文链接
delete原文求助
delete分享
delete收藏
摘要

摘要

En 中文
神经元表型特征,如形态、连接性和功能,在很大程度上由差异表达基因的特定组合决定。转录组空间中的神经元群集对应于不同的细胞类型,并且在某些情况下——例如,秀丽隐杆线虫神经元1和视网膜神经节细胞2、3-4——已被证明共享形态和功能。斑马鱼视顶盖由一个空间排列的神经元组成,这些神经元将视觉输入转化为运动输出。尽管视拓扑图是连续的,但顶盖的亚区域在功能上是特化的5、6。在此,为了揭示顶盖的细胞类型架构,我们对其神经元进行了转录组分析,发现了超过60种细胞类型,这些类型按不同的解剖层组织。我们通过双光子钙成像测量了数千个顶盖神经元的视觉反应,并将这些反应与它们的转录组谱匹配。此外,我们使用特定的转基因品系表征了转录组鉴定出的神经元的形态。值得注意的是,我们发现转录上相似的神经元在形状、连接性和视觉反应上可以存在差异。将神经元在顶盖体积内的空间坐标纳入分析,揭示了单个转录组群集内功能上和形态上定义的解剖亚群集。我们的发现表明,外源性的、位置依赖性因素扩展了基因相似神经元的表型谱。
Keyword:
OPTIC TECTUM
TERMINAL SELECTORS
CELL-TYPE
CLASSIFICATION
DIVERSITY
IMAGE

期刊

Nature 封面图
Nature
IF:
48.5
论文数:
1.8W
被引数:
96.5W

机构

暂无机构信息
引用论文

引用论文

Embryonic origin and lineage hierarchies of the neural progenitor subtypes building the zebrafish adult midbrain
err2016-12-01
err0
errOAAI
errSonya Galant; Giacomo Furlan; Marion Coolen; Lara Dirian; Isabelle Foucher; Laure Bally-Cuif
err分享
err收藏
Molecular topography of an entire nervous system
errCell
IF0
err2021-08-01
err0
errOAAI
errSeth R. Taylor; Gabriel Santpere; Alexis Weinreb; Alec Barrett; Molly B. Reilly; Chuan Xu; Erdem Varol; Panos Oikonomou; Lori Glenwinkel; Rebecca McWhirter; Abigail Poff; Manasa Basavaraju; Ibnul Rafi; Eviatar Yemini; Steven J. Cook; Alexander Abrams; Berta Vidal; Cyril Cros; Saeed Tavazoie; Nenad Sestan; Marc Hammarlund; Oliver Hobert; David M. Miller
err分享
err收藏
CCTop: An Intuitive, Flexible and Reliable CRISPR/Cas9 Target Prediction Tool
err2015-04-24
err0
errOAAI
errManuel Stemmer; Thomas Thumberger; Maria del Sol Keyer; Joachim Wittbrodt; Juan L. Mateo
err分享
err收藏
NeuroD1 reprograms chromatin and transcription factor landscapes to induce the neuronal program
err2015-10-29
err196
errOAAI
errPataskar, Abhijeet; Jung, Johannes; Smialowski, Pawel; Noack, Florian; Calegari, Federico; Straub, Tobias; Tiwari, Vijay K.
err分享
err收藏
Single cell sequencing of radial glia progeny reveals the diversity of newborn neurons in the adult zebrafish brain
err2020-01-09
err58
errOAAI
errLange, Christian; Rost, Fabian; Machate, Anja; Reinhardt, Susanne; Lesche, Matthias; Weber, Anke; Kuscha, Veronika; Dahl, Andreas; Rulands, Steffen; Brand, Michael
err分享
err收藏
err
IF0
err
err0
PREAI
err
err分享
err收藏
err
IF0
err
err0
PREAI
err
err分享
err收藏
oce: an R package for Oceanographic Analysis
err2022-03-03
err0
errOAAI
errDan E. Kelley; Clark Richards; Chantelle Layton
err分享
err收藏
学者 查看更多内容