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Transcriptomic neuron types vary topographically in function and morphology
DOI:10.1038/s41586-024-08518-2.png)
摘要
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神经元表型特征,如形态、连接性和功能,在很大程度上由差异表达基因的特定组合决定。转录组空间中的神经元群集对应于不同的细胞类型,并且在某些情况下——例如,秀丽隐杆线虫神经元1和视网膜神经节细胞2、3-4——已被证明共享形态和功能。斑马鱼视顶盖由一个空间排列的神经元组成,这些神经元将视觉输入转化为运动输出。尽管视拓扑图是连续的,但顶盖的亚区域在功能上是特化的5、6。在此,为了揭示顶盖的细胞类型架构,我们对其神经元进行了转录组分析,发现了超过60种细胞类型,这些类型按不同的解剖层组织。我们通过双光子钙成像测量了数千个顶盖神经元的视觉反应,并将这些反应与它们的转录组谱匹配。此外,我们使用特定的转基因品系表征了转录组鉴定出的神经元的形态。值得注意的是,我们发现转录上相似的神经元在形状、连接性和视觉反应上可以存在差异。将神经元在顶盖体积内的空间坐标纳入分析,揭示了单个转录组群集内功能上和形态上定义的解剖亚群集。我们的发现表明,外源性的、位置依赖性因素扩展了基因相似神经元的表型谱。
Keyword:
OPTIC TECTUM
TERMINAL SELECTORS
CELL-TYPE
CLASSIFICATION
DIVERSITY
IMAGE
期刊
IF:
48.5
论文数:
1.8W
被引数:
96.5W
机构
暂无机构信息
引用论文
NeuroD1 reprograms chromatin and transcription factor landscapes to induce the neuronal program
EMBO JOURNAL
IF8.3
Single cell sequencing of radial glia progeny reveals the diversity of newborn neurons in the adult zebrafish brain
DEVELOPMENT
IF3.6

