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Andrea Ciolfi

Research Centre for Genomics and Bioinformatics

42H-index
191Paper Count
5.9KCitation Count
Published Papers 84
Publication Date
Loss of function of retinol dehydrogenase 11 causes a recessive syndrome characterized by myopathy, retinal dystrophy, juvenile cataracts, and microcephaly
err2026-03-25
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PREAI
errFrancesca Clementina Radio; Giorgio Tasca; Sandra Coppens; Giovanni Chillemi; Sandra Whalen; Isabelle Marey; Chiara Leoni; Roberta Onesimo; Nicolas Deconinck; Adele D’Amico; Gauthier Remiche; Andres Nascimento; Carlos Ortez; Cristina Jou; Sophie Lecomte; Benedetto Falsini; Andrea Ciolfi; Marco Ferilli; Camilla Cappelletti; Marcello Niceta
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Advancing epigenetic signatures as functional biomarkers in rare diseases
err2025-11-05
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PREAI
errAndrea Ciolfi; Marco Ferilli; Camilla Cappelletti; Marco Tartaglia
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The p.Ile202Thr Substitution in TUBB2B Can Be Associated with Syndromic Presentation of Congenital Fibrosis of the Extraocular Muscles
err2025-10-11
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errOAAI
errCecilia Mancini; Luigi Chiriatti; Alessandro Bruselles; Paola D’ambrosio; Andrea Ciolfi; Marco Ferilli; Camilla Cappelletti; Mattia Carvetta; Francesca Clementina Radio; Viviana Cordeddu; Marcello Niceta; Marta Parrino; Rossella Capolino; Corrado Mammì; Rossana Senese; Mario Muto; Manuela Priolo; Marco Tartaglia
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ATHB1 Interacts with Hormone-Related Gene Regulatory Networks Involved in Biotic and Abiotic Stress Responses in Arabidopsis
err2025-09-20
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errOAAI
errValentina Forte; Sabrina Lucchetti; Andrea Ciolfi; Barbara Felici; Marco Possenti; Fabio D’Orso; Giorgio Morelli; Simona Baima
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Genome-wide DNA methylation analysis identifies kidney epigenetic dysregulation in a cystinosis mouse model
err2025-08-21
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errOAAI
errM. N. Rossi; A. Ciolfi; V. Matteo; L. Pedace; C. Nardini; E. Loricchio; I. Caiello; F. Bellomo; A. Taranta; E. De Leo; M. Tartaglia; F. Emma; F. De Benedetti; E. Miele; G. Prencipe
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Diagnosis of Angelman Syndrome, With 66 Years of Delay, Using Hypothesis-Free DNA Methylation Profiling
err2025-06-15
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errOAAI
errMathis Hildonen; Marco Ferilli; Ilona Krey; Oona Kohnen; Camilla Cappelletti; Konrad Platzer; Andrea Ciolfi; Rami Abou Jamra; Marco Tartaglia; Zeynep Tümer
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Biallelic loss-of-function variants in ZNF142 are associated with a robust DNA methylation signature affecting a limited number of genomic loci
err2025-05-23
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PREAI
errHildonen, Mathis; Ciolfi, Andrea; Ferilli, Marco; Cappelletti, Camilla; Al Alam, Chadi; Amor, David J.; Barakat, Tahsin Stefan; Benoit, Valerie; Birk, Ohad Shmuel; Callewaert, Bert; Cazurro-Gutierrez, Ana; De Wachter, Matthias; Doco-Fenzy, Martine; Gomez-Puertas, Paulino; Hammer, Trine Bjorg; Jamra, Rami Abou; Kaiyrzhanov, Rauan; Kameyama, Shinichi; Keren, Boris; Kresge, Christina; Krey, Ilona; Lederer, Damien; Marcos-Alcalde, Inigo; Maroofian, Reza; Matsumoto, Naomichi; Mizuguchi, Takeshi; Moey, Lip-Hen; Morgan, Angela; Munell, Francina; Platzer, Konrad; Pletcher, Beth A.; Ros-Pardo, David; Rumping, Lynne; Szakszon, Katalin; Van Schil, Kristof; Verdura, Edgard; Vogt, Julie; Wassmer, Evangeline; Zamani, Mina; Tumer, Zeynep; Tartaglia, Marco
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Expanding the mutational spectrum of ReNU syndrome: insights into 5' Stem-loop variants
err2025-02-26
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PREAI
errBruselles, Alessandro; Mancini, Cecilia; Chiriatti, Luigi; Carvetta, Mattia; Baroni, Maria Chiara; Cappelletti, Camilla; Caraffi, Stefano Giuseppe; Celario, Massimiliano; Ciolfi, Andrea; Cordeddu, Viviana; De Falco, Alessandro; Ferilli, Marco; Garavelli, Livia; Leoni, Chiara; Meossi, Camilla; Niceta, Marcello; Onesimo, Roberta; Peluso, Francesca; Politano, Davide; Priolo, Manuela; Radio, Francesca Clementina; Santorelli, Filippo; Signorini, Sabrina; Sirchia, Fabio; Valente, Enza Maria; Zampino, Giuseppe; Tartaglia, Marco
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MicroRNAs Expression Profile in MN1-Altered Astroblastoma
err2025-01-06
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errOAAI
errGianno, Francesca; Miele, Evelina; Sabato, Claudia; Ferretti, Elisabetta; Minasi, Simone; Buttarelli, Francesca Romana; Salerno, Debora; Pediconi, Natalia; Pascucci, Giuseppe Rubens; Guerrieri, Francesca; Ciolfi, Andrea; Pizzi, Simone; Massimino, Maura; Biassoni, Veronica; Schiavello, Elisabetta; Gessi, Marco; Asioli, Sofia; Mastronuzzi, Angela; d'Amati, Antonio; Catanzaro, Giuseppina; Viscardi, Elisabetta; Capper, David; Giangaspero, Felice; Antonelli, Manila
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Response to: Are there two disjunct episignatures for KMT2B-related disease?
err2024-12-09
err0
errOAAI
errMonfrini, Edoardo; Ciolfi, Andrea; Ferilli, Marco; Tartaglia, Marco; Di Fonzo, Alessio
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Dominantly acting variants in ATP6V1C1 and ATP6V1B2 cause a multisystem phenotypic spectrum by altering lysosomal and/or autophagosome function
err2024-10-01
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errOAAI
errCarpentieri, Giovanna; Cecchetti, Serena; Bocchinfuso, Gianfranco; Radio, Francesca Clementina; Leoni, Chiara; Onesimo, Roberta; Calligari, Paolo; Pietrantoni, Agostina; Ciolfi, Andrea; Ferilli, Marco; Calderan, Cristina; Cappuccio, Gerarda; Martinelli, Simone; Messina, Elena; Caputo, Viviana; Hueffmeier, Ulrike; Mignot, Cyril; Auvin, Stephane; Capri, Yline; Lourenco, Charles Marques; Russell, Bianca E.; Neustad, Ahna; Pierri, Nicola Brunetti; Keren, Boris; Reis, Andre; Cohen, Julie S.; Heidlebaugh, Alexis; Smith, Clay; Thiel, Christian T.; Salviati, Leonardo; Zampino, Giuseppe; Campeau, Philippe M.; Stella, Lorenzo; Tartaglia, Marco; Flex, Elisabetta
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Loss-of-Function Variants in CUL3 Cause a Syndromic Neurodevelopmental Disorder
err2024-09-20
err2
PREAI
errBlackburn, Patrick R.; Ebstein, Frederic; Hsieh, Tzung-Chien; Motta, Marialetizia; Radio, Francesca Clementina; Herkert, Johanna C.; Rinne, Tuula; Thiffault, Isabelle; Rapp, Michele; Alders, Mariel; Maas, Saskia; Gerard, Benedicte; Smol, Thomas; Vincent-Delorme, Catherine; Cogne, Benjamin; Isidor, Bertrand; Vincent, Marie; Bachmann-Gagescu, Ruxandra; Rauch, Anita; Joset, Pascal; Ferrero, Giovanni Battista; Ciolfi, Andrea; Husson, Thomas; Guerrot, Anne-Marie; Bacino, Carlos; Macmurdo, Colleen; Thompson, Stephanie S.; Rosenfeld, Jill A.; Faivre, Laurence; Mau-Them, Frederic Tran; Deb, Wallid; Vignard, Virginie; Agrawal, Pankaj B.; Madden, Jill A.; Goldenberg, Alice; Lecoquierre, Francois; Zech, Michael; Prokisch, Holger; Necpal, Jan; Jech, Robert; Winkelmann, Juliane; Koprusakova, Monika Turcanova; Konstantopoulou, Vassiliki; Younce, John R.; Shinawi, Marwan; Mighton, Chloe; Fung, Charlotte; Morel, Chantal F.; Lerner-Ellis, Jordan; Ditroia, Stephanie; Barth, Magalie; Bonneau, Dominique; Krapels, Ingrid; Stegmann, Alexander P. A.; van Der Schoot, Vyne; Brunet, Theresa; Bussmann, Cornelia; Mignot, Cyril; Zampino, Giuseppe; Wortmann, Saskia B.; Mayr, Johannes A.; Feichtinger, Rene G.; Courtin, Thomas; Ravelli, Claudia; Keren, Boris; Ziegler, Alban; Hasadsri, Linda; Pichurin, Pavel N.; Klee, Eric W.; Grand, Katheryn; Sanchez-Lara, Pedro A.; Krueger, Elke; Bezieau, Stephane; Klinkhammer, Hannah; Krawitz, Peter Michael; Eichler, Evan E.; Tartaglia, Marco; Kuery, Sebastien; Wang, Tianyun
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Ketogenic Diet and Progression of Kidney Disease in Animal Models of Nephropathic Cystinosis
err2024-07-12
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PREAI
errBellomo, Francesco; Pugliese, Sara; Cairoli, Sara; Krohn, Patrick; De Stefanis, Cristiano; Raso, Roberto; Rega, Laura Rita; Taranta, Anna; De Leo, Ester; Ciolfi, Andrea; Cicolani, Nicolo; Petrini, Stefania; Luciani, Alessandro; Goffredo, Bianca Maria; Porzio, Ottavia; Devuyst, Olivier; Dionisi-Vici, Carlo; Emma, Francesco
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GENOME-WIDE DNA METHYLATION PROFILING OF PRIMARY CELLS FROM PEDIATRIC BRAIN TUMORS IS AN INFORMATIVE TOOL TO ASSESS CELL CULTURE RELIABILITY AND IN VITRO SELECTION
err2024-06-18
err0
errOAAI
errPedace, Lucia; Abballe, Luana; Pizzi, Simone; Vinci, Maria; Antonacci, Celeste; Nardini, Claudia; Patrizi, Sara; Del Bufalo, Francesca; Rossi, Sabrina; Pericoli, Giulia; Gianno, Francesca; Besharat, Zein Mersini; Tiberi, Luca; Mastronuzzi, Angela; Ferretti, Elisabetta; Tartaglia, Marco; Locatelli, Franco; Ciolfi, Andrea; Miele, Evelina
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Loss-of-function variants in ERF are associated with a Noonan syndrome-like phenotype with or without craniosynostosis
err2024-06-01
err3
PREAI
errDentici, Maria Lisa; Niceta, Marcello; Lepri, Francesca Romana; Mancini, Cecilia; Priolo, Manuela; Bonnard, Adeline Alice; Cappelletti, Camilla; Leoni, Chiara; Ciolfi, Andrea; Pizzi, Simone; Cordeddu, Viviana; Rossi, Cesare; Ferilli, Marco; Mucciolo, Mafalda; Colona, Vito Luigi; Fauth, Christine; Bellini, Melissa; Biasucci, Giacomo; Sinibaldi, Lorenzo; Briuglia, Silvana; Gazzin, Andrea; Carli, Diana; Memo, Luigi; Trevisson, Eva; Schiavariello, Concetta; Luca, Maria; Novelli, Antonio; Michot, Caroline; Sweertvaegher, Anne; Germanaud, David; Scarano, Emanuela; De Luca, Alessandro; Zampino, Giuseppe; Zenker, Martin; Mussa, Alessandro; Dallapiccola, Bruno; Cave, Helene; Digilio, Maria Cristina; Tartaglia, Marco
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A case of T-cell acute lymphoblastic leukemia in retroviral gene therapy for ADA-SCID
err2024-04-30
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errOAAI
errCesana, Daniela; Cicalese, Maria Pia; Calabria, Andrea; Merli, Pietro; Caruso, Roberta; Volpin, Monica; Rudilosso, Laura; Migliavacca, Maddalena; Barzaghi, Federica; Fossati, Claudia; Gazzo, Francesco; Pizzi, Simone; Ciolfi, Andrea; Bruselles, Alessandro; Tucci, Francesca; Spinozzi, Giulio; Pais, Giulia; Benedicenti, Fabrizio; Barcella, Matteo; Merelli, Ivan; Gallina, Pierangela; Giannelli, Stefania; Dionisio, Francesca; Scala, Serena; Casiraghi, Miriam; Strocchio, Luisa; Vinti, Luciana; Pacillo, Lucia; Draghi, Eleonora; Cesana, Marcella; Riccardo, Sara; Colantuono, Chiara; Six, Emmanuelle; Cavazzana, Marina; Carlucci, Filippo; Schmidt, Manfred; Cancrini, Caterina; Ciceri, Fabio; Vago, Luca; Cacchiarelli, Davide; Gentner, Bernhard; Naldini, Luigi; Tartaglia, Marco; Montini, Eugenio; Locatelli, Franco; Aiuti, Alessandro
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Evaluating cell culture reliability in pediatric brain tumor primary cells through DNA methylation profiling
err2024-04-18
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errOAAI
errPedace, Lucia; Pizzi, Simone; Abballe, Luana; Vinci, Maria; Antonacci, Celeste; Patrizi, Sara; Nardini, Claudia; Del Bufalo, Francesca; Rossi, Sabrina; Pericoli, Giulia; Gianno, Francesca; Besharat, Zein Mersini; Tiberi, Luca; Mastronuzzi, Angela; Ferretti, Elisabetta; Tartaglia, Marco; Locatelli, Franco; Ciolfi, Andrea; Miele, Evelina
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RAF1 gene fusions are recurrent driver events in infantile fibrosarcoma-like mesenchymal tumors
err2024-04-17
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PREAI
errMotta, Marialetizia; Barresi, Sabina; Pizzi, Simone; Bifano, Delfina; Lopez Marti, Jennifer; Garrido-Pontnou, Marta; Flex, Elisabetta; Bruselles, Alessandro; Giovannoni, Isabella; Rotundo, Giovannina; Fragale, Alessandra; Tirelli, Valentina; Vallese, Silvia; Ciolfi, Andrea; Bisogno, Gianni; Alaggio, Rita; Tartaglia, Marco
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Clinicopathological and molecular landscape of 5-year IDH-wild-type glioblastoma survivors: A multicentric retrospective study
err2024-04-01
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PREAI
errMiele, Evelina; Anghileri, Elena; Calatozzolo, Chiara; Lazzarini, Elisabetta; Patrizi, Sara; Ciolfi, Andrea; Pedace, Lucia; Patane, Monica; Abballe, Luana; Paterra, Rosina; Maddaloni, Luisa; Barresi, Sabina; Mastronuzzi, Angela; Petruzzi, Alessandra; Tramacere, Irene; Farinotti, Mariangela; Gurrieri, Lorena; Pirola, Elena; Scarpelli, Mauro; Lombardi, Giuseppe; Villani, Veronica; Simonelli, Matteo; Merli, Rossella; Salmaggi, Andrea; Tartaglia, Marco; Silvani, Antonio; Dimeco, Francesco; Calistri, Daniele; Lamperti, Elena; Locatelli, Franco; Indraccolo, Stefano; Pollo, Bianca
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