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Contrastive Learning-Based Method for Single-Cell Multi-omics Data Clustering
DOI:10.1007/978-981-95-0698-9_29.png)
摘要
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单细胞多组学数据聚类的对比学习方法scCLC:基于对比学习的单细胞多组学数据聚类方法scCLC,通过对比学习框架整合单细胞RNA测序数据和单细胞ATAC测序数据,采用专门的数据增强策略和自监督学习模型进行细胞表征学习。该方法利用单细胞多组学数据拓扑结构确定正样本对,不仅增大训练样本量,还为模型提供基础标签先验以学习更利于聚类的细胞表征。在单细胞多组学数据集上的实验结果表明,scCLC具有优异的聚类性能;应用于可视化时,能有效区分细胞亚型。
Keyword:
Single-cell Multi-omics
Cell Heterogeneity
Self-supervised Learning
期刊
B
IF:
0
论文数:
25
被引数:
0
机构
引用论文
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